RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000292211.4

UBE2Q1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2Q1, Length 3,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-201ENST00000292211 GALTP07902 379 aa21.15■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC166P0CW27 439 aa21.15■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 MAGEA11P43364 429 aa21.15■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZNF470Q6ECI4 717 aa21.15■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 PNPLA1Q8N8W4 532 aa21.15■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC43A3Q8NBI5 491 aa21.15■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 MOCOSQ96EN8 888 aa21.15■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 C1orf74Q96LT6 269 aa21.15■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.15■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCNQ1P51787 676 aa21.14■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 GPR17Q13304 367 aa21.14■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 GPNMBQ14956 572 aa21.14■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 TAF12Q16514 161 aa21.14■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 NPAS4Q8IUM7 802 aa21.14■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMYD1Q8NB12 490 aa21.14■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 NAT14Q8WUY8 206 aa21.14■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 INPP5DQ92835 1189 aa21.14■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 GATA6Q92908 595 aa21.14■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRGPRX2Q96LB1 330 aa21.14■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 NMRAL1Q9HBL8 299 aa21.14■□□□□ 0.98
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC22O60826 627 aa21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 HSPA4LO95757 839 aa21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 GSRP00390 522 aa21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 AHSGP02765 367 aa21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 PSMD7P51665 324 aa21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 MSANTD2Q6P1R3 559 aa21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 SNNO75324 88 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 FGFR3P22607 806 aa21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR1D2P34982 312 aa21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 CTC1Q2NKJ3 1217 aa21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 SPON2Q9BUD6 331 aa21.14■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCL22O00626 93 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 ADAM12O43184 909 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 MPOP05164 745 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 PAMP19021 973 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC12A2P55011 1212 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 CSE1LP55060 971 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 MTTPP55157 894 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 INSCQ1MX18 579 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 TCTN1Q2MV58 587 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 CCDC153Q494R4 210 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 DENND5AQ6IQ26 1287 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 OR6P1Q8NGX9 317 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 ELMO2Q96JJ3 720 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 TCAF1Q9Y4C2 921 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 FKTNO75072 461 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 LGI2Q8N0V4 545 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 PPP1R36Q96LQ0 422 aa21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 VWA8A3KMH1 1905 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 H7C4K7 107 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 COL6A1P12109 1028 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACVRL1P37023 503 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 POTEHQ6S545 545 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 ANKS3Q6ZW76 656 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 KCTD4Q8WVF5 259 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 RHOJQ9H4E5 214 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 TK2O00142 265 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 WFS1O76024 890 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 ACSBG2Q5FVE4 666 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 RNF135Q8IUD6 432 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 FBXO22Q8NEZ5 403 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 DNAJB2P25686 324 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 STXBP5Q5T5C0 1151 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 SGF29Q96ES7 293 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 TUBB6Q9BUF5 446 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 SLC25A51Q9H1U9 297 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 HIPK3Q9H422 1215 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 BUD23O43709 281 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 IL1BP01584 269 aa21.11■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 GRK2P25098 689 aa21.11■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 NDST2P52849 883 aa21.11■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 UGP2Q16851 508 aa21.11■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 SMUG1Q53HV7 270 aa21.11■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 TREML1Q86YW5 311 aa21.11■□□□□ 0.97
UBE2Q1-201ENST00000292211 LRRC49Q8IUZ0 686 aa21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.1 ms