RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285681.6

USP25-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 5,216 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-202ENST00000285681 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ASF1AQ9Y294 204 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 RWDD3Q9Y3V2 267 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CAPN15O75808 1086 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SHBGP04278 402 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 NTRK1P04629 796 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 UMPSP11172 480 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CLYBLQ8N0X4 340 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 MYLK2Q9H1R3 596 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CD248Q9HCU0 757 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 NFATC1O95644 943 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PROCP04070 461 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PAICSP22234 425 aaKnown RBP20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 XKR6Q5GH73 641 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 FAM124AQ86V42 546 aa20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PLIN4Q96Q06 1357 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 LGR5O75473 907 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TEX44Q53QW1 395 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ZFP1Q6P2D0 407 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TXNDC11Q6PKC3 985 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 OR52K2Q8NGK3 314 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CKAP2Q8WWK9 683 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TIFAQ96CG3 184 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CHKBQ9Y259 395 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 POLR1DQ9Y2S0 133 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ARL5CA6NH57 179 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PDE5AO76074 875 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CBX6O95503 412 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 OTCP00480 354 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 UQCRBP14927 111 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CRATP43155 626 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 KIAA2013Q8IYS2 634 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 HEXDCQ8WVB3 486 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ALG3Q92685 438 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TMEM237Q96Q45 408 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PEX6Q13608 980 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 NOMO1Q15155 1222 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 GPRIN3Q6ZVF9 776 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 GATAD2AQ86YP4 633 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 COPZ1P61923 177 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SLC30A9Q6PML9 568 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CDYL2Q8N8U2 506 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 POMGNT2Q8NAT1 580 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SNX27Q96L92 541 aa20.36■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 VAV1P15498 845 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SERPINB1P30740 379 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 HNF4AP41235 474 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 IRF2BP1Q8IU81 584 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 VWA7Q9Y334 891 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 RHOQP17081 205 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 RPL3P39023 403 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SLC26A9Q7LBE3 791 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 OR6Y1Q8NGX8 325 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 RBPJLQ9UBG7 517 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SORCS3Q9UPU3 1222 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 EFR3BQ9Y2G0 817 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 FAM20BO75063 409 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 TACR2P21452 398 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 LILRA4P59901 499 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ARCQ7LC44 396 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 LINGO1Q96FE5 620 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 APOL4Q9BPW4 351 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ZNF232Q9UNY5 417 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ALOX15BO15296 676 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PRR23CQ6ZRP0 262 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 RDH11Q8TC12 318 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 FNIP1Q8TF40 1166 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 FERD3LQ96RJ6 166 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 XPR1Q9UBH6 696 aa20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 RECQL5O94762 991 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 OR6A2O95222 327 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 NDRG1Q92597 394 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 DEPDC7Q96QD5 511 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ZSCAN32Q9NX65 697 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 AVILO75366 819 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 EOMESO95936 686 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PIK3R1P27986 724 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SETD9Q8NE22 299 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ZFP14Q9HCL3 533 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 GSAPA4D1B5 854 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 CLOCKO15516 846 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PEX1O43933 1283 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 GCATO75600 419 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 PCDHGC3Q9UN70 934 aa20.34■□□□□ 0.85
USP25-202ENST00000285681 E9PAM4 449 aa20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.2 ms