RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 PROX1Q92786 737 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 CORO2BQ9UQ03 480 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM38O00635 465 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 AVILO75366 819 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 BPGMP07738 259 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 OR1D2P34982 312 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PSME3P61289 254 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 SYN3O14994 580 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 WARSP23381 471 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 CCNCP24863 283 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PKNOX1P55347 436 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PFKPQ01813 784 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 CTBP1Q13363 440 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PTPRHQ9HD43 1115 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 C5orf60A6NFR6 353 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 CLTBP09497 229 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 NTSP30990 170 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 TMPRSS4Q9NRS4 437 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PSME2Q9UL46 239 aa20.49■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 AZIN1O14977 448 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 HS6ST1O60243 411 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PIGRP01833 764 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 LLGL2Q6P1M3 1020 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 TTC7BQ86TV6 843 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 KRT73Q86Y46 540 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 TIFAQ96CG3 184 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF180Q9UJW8 692 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 RGS5O15539 181 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 TGDSO95455 350 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 L1CAMP32004 1257 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 TAF10Q12962 218 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 FAM46CQ5VWP2 391 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 RD3Q7Z3Z2 195 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF276Q8N554 614 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 CPT1BQ92523 772 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 CD101Q93033 1021 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 COPS8Q99627 209 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 CDH19Q9H159 772 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 LRMDAQ9H2I8 198 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 ADAM30Q9UKF2 790 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 LRRC37A3O60309 1634 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PEX1O43933 1283 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 CNPP09543 421 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 GPR1P46091 355 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 TPD52L3Q96J77 140 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 NR2E3Q9Y5X4 410 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 A0A087WXM4 84 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 M0R2N6 131 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 MFSD11O43934 449 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 OMDQ99983 421 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 GBA3Q9H227 469 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 REEP1Q9H902 201 aa20.48■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 GCATO75600 419 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 SMPD1P17405 629 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 THOP1P52888 689 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PRKG2Q13237 762 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 ARHGAP17Q68EM7 881 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PMF1Q6P1K2 205 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 LPCAT2Q7L5N7 544 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 SLC9A7Q96T83 725 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 SDCBP2Q9H190 292 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 RPS6KA6Q9UK32 745 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 A0A1W2PQ67 120 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PEX11AO75192 247 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 USP7Q93009 1102 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 A0A1B0GW55 424 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 A0A1W2PPM1 405 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 DUX4L2P0CJ85 424 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 DUX4L3P0CJ86 424 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 DUX4L4P0CJ87 422 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 DUX4L5P0CJ88 424 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 DUX4L6P0CJ89 424 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 DUX4L7P0CJ90 424 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 IDO1P14902 403 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 MAPKAPK3Q16644 382 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 C10orf107Q8IVU9 208 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 ZFP28Q8NHY6 868 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 SH3GL2Q99962 352 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 SIX2Q9NPC8 291 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 DUX4Q9UBX2 424 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 PLLPQ9Y342 182 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 DUOX1Q9NRD9 1551 aa20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 RPP40O75818 363 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
LRIG1-201ENST00000273261 AP2A1O95782 977 aa20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms