RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259351.9

RALGPS1-201, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 6,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-201ENST00000259351 SNX6Q9UNH7 406 aa12.97□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ENTPD4Q9Y227 616 aa12.97□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ATP6V1C1P21283 382 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 GTF2E2P29084 291 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 PPIL2Q13356 520 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 TIGD2Q4W5G0 525 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 TREML2Q5T2D2 321 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 RP9Q8TA86 221 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 REXO5Q96IC2 774 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CORO1BQ9BR76 489 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 NMUR2Q9GZQ4 415 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 AGLP35573 1532 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 EFCAB10A6NFE3 127 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 MTA2O94776 668 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 COMMD2Q86X83 199 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CLPTM1LQ96KA5 538 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 AZIN1O14977 448 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 C2P06681 752 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 MPSTP25325 297 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 CDK18Q07002 472 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 DLG2Q15700 870 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 PERM1Q5SV97 790 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 HYIQ5T013 277 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ZNF618Q5T7W0 954 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 KLHL17Q6TDP4 642 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 AFTPHQ6ULP2 937 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 TRPM4Q8TD43 1214 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 SPACA7Q96KW9 195 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 MRIQ9BWK5 157 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 DUSP16Q9BY84 665 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 TMEM51Q9NW97 253 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 GNPTGQ9UJJ9 305 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa12.96□□□□□ -0.33
RALGPS1-201ENST00000259351 KIF20BQ96Q89 1820 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 MLYCDO95822 493 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 PRKG2Q13237 762 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 NOMO2Q5JPE7 1267 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 PAGE2BQ5JRK9 111 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 CASZ1Q86V15 1759 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 H3BMM5 538 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 TLR5O60602 858 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 PTSQ03393 145 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 FAM151BQ6UXP7 276 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 OTOP3Q7RTS5 596 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 LINGO1Q96FE5 620 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 VWA7Q9Y334 891 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 GMPPBQ9Y5P6 360 aa12.96□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 GPR142Q7Z601 462 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 FNIP1Q8TF40 1166 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 ASZ1Q8WWH4 475 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 PPP1R14AQ96A00 147 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 FAM192AQ9GZU8 254 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 TOR4AQ9NXH8 423 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 PLK2Q9NYY3 685 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 MCM8Q9UJA3 840 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 BPGMP07738 259 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 TSHRP16473 764 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 PSMD5Q16401 504 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 PPM1JQ5JR12 505 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 LPCAT4Q643R3 524 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 HIPK1Q86Z02 1210 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 VPS35Q96QK1 796 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 OSBPL6Q9BZF3 934 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 EPB41L1Q9H4G0 881 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 POLR1DQ9Y2S0 133 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP12.95□□□□□ -0.344e-7■■■■■ 133.7
RALGPS1-201ENST00000259351 CENPXA8MT69 81 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 PAGE1O75459 146 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 NOMO1Q15155 1222 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 FBXO48Q5FWF7 155 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 TTC23Q5W5X9 447 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 RAET1GQ6H3X3 334 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 IZUMO1Q8IYV9 350 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 RASGEF1CQ8N431 466 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 OR7A2PQ8NGA2 310 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 CLIP3Q96DZ5 547 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 CSPG4P5Q96PW8 444 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 BIRC5O15392 142 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 XYLBO75191 536 aa12.95□□□□□ -0.34
RALGPS1-201ENST00000259351 CST1P01037 141 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33 ms