RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 KLK6Q92876 244 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 SLC6A18Q96N87 628 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa22.5■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 A0A1W2PR77 199 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 PCDH8O95206 1070 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 JCHAINP01591 159 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 MAPK8P45983 427 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 RACK1P63244 317 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 BCL2L1Q07817 233 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 NIPAL4Q0D2K0 466 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 LAYNQ6UX15 382 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 BBS5Q8N3I7 341 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 OSBPL8Q9BZF1 889 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 LZTFL1Q9NQ48 299 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 AMACRQ9UHK6 382 aa22.49■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 LOC105378220A0A1B0GUY1 285 aaPredicted RBP22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP33O14559 1287 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 TSPAN6O43657 245 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 SERPINA4P29622 427 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 ARHGAP8P85298 464 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 AP1B1Q10567 949 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 TRAF2Q12933 501 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 FEM1CQ96JP0 617 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 SEMA3CQ99985 751 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 EDEM2Q9BV94 578 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 BRD8Q9H0E9 1235 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 LRRK1Q38SD2 2015 aa22.48■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 A0A1B0GVT2 93 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 UPK3BL1B0FP48 263 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 UPK3BL2E5RIL1 263 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 FZD6O60353 706 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 PRKCGP05129 697 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 MMP2P08253 660 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 PRLRP16471 622 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 GRIA4P48058 902 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 LIMK1P53667 647 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 DSC2Q02487 901 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 GRIK2Q13002 908 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 TMEM52BQ4KMG9 183 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 TMEM145Q8NBT3 493 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 OR2I1PQ8NGU4 316 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 P3H4Q92791 437 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 HAUS1Q96CS2 278 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 SERAC1Q96JX3 654 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 PCDH12Q9NPG4 1184 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 DMTF1Q9Y222 760 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 CA5BQ9Y2D0 317 aa22.47■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 IGLON5A6NGN9 336 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 SLC31A1O15431 190 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 SOCS5O75159 536 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 APOC2P02655 101 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 NUDT1P36639 197 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 SUOXP51687 545 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 RPS21P63220 83 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 GSE1Q14687 1217 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 STPG1Q5TH74 334 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 MEI1Q5TIA1 1274 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 RMDN1Q96DB5 314 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 SLC17A9Q9BYT1 436 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 CEP41Q9BYV8 373 aa22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 ASCC3Q8N3C0 2202 aaKnown RBP22.46■■□□□ 1.19
SYF2-201ENST00000236273 TM4SF5O14894 197 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 VILLO15195 856 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 RAD51BO15315 384 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 PRLP01236 227 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 PDHA1P08559 390 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 SEMG2Q02383 582 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ITKQ08881 620 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 WASHC5Q12768 1159 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 NOMO1Q15155 1222 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 KIF19Q2TAC6 998 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 UBL4BQ8N7F7 174 aa22.45■■□□□ 1.18
SYF2-201ENST00000236273 NETO1Q8TDF5 533 aa22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.3 ms