RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000233072.9

CPS1-201, Transcript of carbamoyl-phosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CPS1, Length 5,821 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1-201ENST00000233072 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CYP7B1O75881 506 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OR6B1O95007 311 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MAP3K6O95382 1288 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NUDT14O95848 222 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 UGT1A5P35504 534 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MATKP42679 507 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PDK4Q16654 411 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SMIM5Q71RC9 77 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SPATA20Q8TB22 786 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TEX47Q8TBZ9 253 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MYO19Q96H55 970 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CCDC28BQ9BUN5 200 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CDH19Q9H159 772 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BRD9Q9H8M2 597 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NR2E3Q9Y5X4 410 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 IFT172Q9UG01 1749 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 A0A0B4J269 797 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC25A12O75746 678 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SSTR1P30872 391 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SOX10P56693 466 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MTM1Q13496 603 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 VGLL4Q14135 290 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC47A1Q96FL8 570 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PNPLA3Q9NST1 481 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KLQ9UEF7 1012 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ADRB2P07550 413 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RAP1GAP2Q684P5 730 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC30A8Q8IWU4 369 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CCDC185Q8N715 623 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OR52K1Q8NGK4 314 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SOHLH2Q9NX45 425 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NUDT4Q9NZJ9 180 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GMIPQ9P107 970 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TBC1D14Q9P2M4 693 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DKK3Q9UBP4 350 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 IKZF3Q9UKT9 509 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SH3GLB1Q9Y371 365 aa7.26□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TRIM43BA6NCK2 446 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TAF4O00268 1085 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CACNB4O00305 520 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FKTNO75072 461 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CCNYL3P0C7X3 344 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GRIA4P48058 902 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 WSCD1Q658N2 575 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 VPS45Q9NRW7 570 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GALNT8Q9NY28 637 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MRPS33Q9Y291 106 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 H3BNH8 94 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 EML1O00423 815 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ULK1O75385 1050 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ZCCHC18P0CG32 403 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 AMD1P17707 334 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 FLT3P36888 993 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SLC26A3P40879 764 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 EIF2B2P49770 351 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SCNN1GP51170 649 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PSME3P61289 254 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 BNC1Q01954 994 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 ELP6Q0PNE2 266 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MPPE1Q53F39 396 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 KLHL17Q6TDP4 642 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 VGLL2Q8N8G2 317 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OR4A15Q8NGL6 344 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 OR4L1Q8NH43 312 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MCRS1Q96EZ8 462 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PDCD10Q9BUL8 212 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CDT1Q9H211 546 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 AGO1Q9UL18 857 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SNPHO15079 494 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 CHST10O43529 356 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 TSPAN9O75954 239 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 NOMO3P69849 1222 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 MIIPQ5JXC2 388 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 GPR142Q7Z601 462 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 RASAL3Q86YV0 1011 aa7.25□□□□□ -1.25
CPS1-201ENST00000233072 SHC3Q92529 594 aa7.25□□□□□ -1.25
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