RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 FOXR1Q6PIV2 292 aa15.93■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.93■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa15.93■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 PYROXD2Q8N2H3 581 aa15.93■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 RTL3Q8N8U3 475 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa15.93■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 COL26A1Q96A83 441 aa15.93■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.93■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 ITGA2BP08514 1039 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 KRT3P12035 628 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 BLKP51451 505 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 SUOXP51687 545 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 IRF4Q15306 451 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 CYTH1Q15438 398 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 ALG11Q2TAA5 492 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 CCDC81Q6ZN84 652 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 ARL10Q8N8L6 244 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 HCAR2Q8TDS4 363 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 FAM172AQ8WUF8 416 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 MED8Q96G25 268 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 PCDHB18PQ96TA0 734 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 C11orf70Q9BRQ4 267 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 EDEM3Q9BZQ6 932 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 GULP1Q9UBP9 304 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 LHX3Q9UBR4 397 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 UNC13CQ8NB66 2214 aa15.92■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 A0A1W2PQM1 296 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 TSPAN11A1L157 253 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 WASH4PA8MWX3 477 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 PES1O00541 588 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 NOBOXO60393 691 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 IGSF6O95976 241 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 GSCP56915 257 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 JAM2P57087 298 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 RHOAP61586 193 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 CCL7P80098 99 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 SERINC3Q13530 473 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 LRRC14Q15048 493 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 AGERQ15109 404 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 ELOCQ15369 112 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 WDR59Q6PJI9 974 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 SLFN11Q7Z7L1 901 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 HID1Q8IV36 788 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 PCDH19Q8TAB3 1148 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 CCDC74AQ96AQ1 378 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 HMCESQ96FZ2 354 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 APOOQ9BUR5 198 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 CLSTN2Q9H4D0 955 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 COQ6Q9Y2Z9 468 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa15.91■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 MYO18BQ8IUG5 2567 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 RASA4BC9J798 803 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 PLD2O14939 933 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 EPHB6O15197 1021 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 RASA4O43374 803 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 RASGRP1O95267 797 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 ALPIP09923 528 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 EPHB2P29323 1055 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 SLC5A2P31639 672 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 UGT1A5P35504 534 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 SOX5P35711 763 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 KLK7P49862 253 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 ELP6Q0PNE2 266 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 EIF3IQ13347 325 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 INPP5AQ14642 412 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 NFATC4Q14934 902 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 UGP2Q16851 508 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 KCTD16Q68DU8 428 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 ENPP7Q6UWV6 458 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 TRIM72Q6ZMU5 477 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 UMODL1-AS1Q8N2C9 162 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 FBXO39Q8N4B4 442 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 KYQ8NBH2 561 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 SUV39H2Q9H5I1 410 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 PCDH12Q9NPG4 1184 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 TAB2Q9NYJ8 693 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 SIRPGQ9P1W8 387 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 ACSL6Q9UKU0 697 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 DOLKQ9UPQ8 538 aa15.9■□□□□ 0.14
NME3-201ENST00000219302 LRRK1Q38SD2 2015 aa15.89■□□□□ 0.13
NME3-201ENST00000219302 SIGLEC16A6NMB1 481 aa15.89■□□□□ 0.13
NME3-201ENST00000219302 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa15.89■□□□□ 0.13
NME3-201ENST00000219302 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
NME3-201ENST00000219302 PIGNO95427 931 aa15.89■□□□□ 0.13
NME3-201ENST00000219302 CTSEP14091 401 aa15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms