RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216014.8

KDELR3-201, Transcript of KDEL endoplasmic reticulum protein retention receptor 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene KDELR3, Length 1,728 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR3-201ENST00000216014 GOLGA8MH3BSY2 632 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 DNALI1O14645 258 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ALOX15BO15296 676 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SLC34A2O95436 690 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 PIRTP0C851 137 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 C7P10643 843 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 TIMP2P16035 220 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 FDFT1P37268 417 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ABL2P42684 1182 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 MAGEA6P43360 314 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 CLCN5P51795 746 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SIRPB2Q5JXA9 342 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ANO7Q6IWH7 933 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 RANBP10Q6VN20 620 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SLC25A41Q8N5S1 370 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 NEUROG2Q9H2A3 272 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 GGT7Q9UJ14 662 aa20.14■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 TSPAN11A1L157 253 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 C16orf96A6NNT2 1141 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ANXA9O76027 345 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ALPIP09923 528 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 CTPS1P17812 591 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SERPINA4P29622 427 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ACTN2P35609 894 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 GEMP55040 296 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 GUCY2DQ02846 1103 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 CNTN1Q12860 1018 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 MPP3Q13368 585 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF805Q5CZA5 627 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 RALGPS1Q5JS13 557 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 FRMD1Q8N878 549 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 LPCAT1Q8NF37 534 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SEC14L1Q92503 715 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ITM2BQ9Y287 266 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SOCS5O75159 536 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 AVILO75366 819 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 PRNPP04156 253 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 CES1P23141 567 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 DGKEP52429 567 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ITGA8P53708 1063 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 CDK18Q07002 472 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 QPCTQ16769 361 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 PIP5KL1Q5T9C9 394 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 OR52K1Q8NGK4 314 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 FEM1CQ96JP0 617 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 EPB41L5Q9HCM4 733 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 VPS45Q9NRW7 570 aa20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 A0A1W2PP55 124 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 A8MX80 341 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ATG13O75143 517 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SUN1O94901 812 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 TPH1P17752 444 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ITGB7P26010 798 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 P2RY2P41231 377 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 MAPK8P45983 427 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 TAS2R38P59533 333 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 PRPSAP1Q14558 356 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 E2F5Q15329 346 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SLC1A5Q15758 541 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SLC14A2Q15849 920 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SNF8Q96H20 258 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 TPSD1Q9BZJ3 242 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 VPS13AQ96RL7 3174 aa20.12■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 BANF1O75531 89 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 TDGF1P13385 188 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 TPSB2P20231 275 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ECHS1P30084 290 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 RAD51Q06609 339 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 TPSAB1Q15661 275 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 ARMC12Q5T9G4 340 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 AGBL4Q5VU57 503 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 C4orf22Q6V702 233 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 FBXL6Q8N531 539 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 TSTD1Q8NFU3 115 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SIPA1Q96FS4 1042 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 LRIG1Q96JA1 1093 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 E7EVH7 732 aa20.1■□□□□ 0.81
KDELR3-201ENST00000216014 AURKAO14965 403 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.5 ms