RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641643.1

SYT6-210, Transcript of synaptotagmin 6, humanhuman

BASIC

Gene SYT6, Length 1,587 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT6-210ENST00000641643 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP22.63■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 ZNF235Q14590 738 aa22.63■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 TMEM259Q4ZIN3 620 aa22.63■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 SRLQ86TD4 932 aa22.63■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 TMEM145Q8NBT3 493 aa22.63■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 HCAR2Q8TDS4 363 aa22.63■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 VOPP1Q96AW1 172 aa22.63■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 KLHDC7BQ96G42 594 aa22.63■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa22.63■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 FZD3Q9NPG1 666 aa22.63■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 CA5BQ9Y2D0 317 aa22.63■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 FLRT2O43155 660 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 MTA2O94776 668 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 SERPINA4P29622 427 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 SCNN1BP51168 640 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 NXPH1P58417 271 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 ODF2Q5BJF6 829 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 LRRC49Q8IUZ0 686 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 OXR1Q8N573 874 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 SPC24Q8NBT2 197 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 CAMK1GQ96NX5 476 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 PSKH2Q96QS6 385 aa22.62■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 A0A1B0GTQ1 180 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 YKT6O15498 198 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 SLC1A1P43005 524 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 NOP2P46087 812 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 SUOXP51687 545 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 IL9RQ01113 521 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 SLC10A7Q0GE19 358 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 LRRC73Q5JTD7 316 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 PCDH19Q8TAB3 1148 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 RHBDD1Q8TEB9 315 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 PANX2Q96RD6 677 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 IMPACTQ9P2X3 320 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 ITM2BQ9Y287 266 aa22.61■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 IGLON5A6NGN9 336 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 PCDHGA12O60330 932 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 MAFKO60675 156 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 THEGLP0DJG4 465 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 TIMP2P16035 220 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 RGRP47804 291 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 BCL2L1Q07817 233 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 ELP6Q0PNE2 266 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 INAVAQ3KP66 663 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 FAM174AQ8TBP5 190 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 GGT7Q9UJ14 662 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa22.6■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 LRRD1A4D1F6 860 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 AREL1O15033 823 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 KDELR1P24390 212 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 AP1S1P61966 158 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 TCEAL1Q15170 157 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 UGP2Q16851 508 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 MARC1Q5VT66 337 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 ERAP2Q6P179 960 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 DBX2Q6ZNG2 339 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 MFSD11O43934 449 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 LCA5LO95447 670 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 GRK6P43250 576 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 TMTC1Q8IUR5 882 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 RAPGEF5Q92565 580 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.59■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 TMEM131Q92545 1883 aa22.58■■□□□ 1.21
SYT6-210ENST00000641643 A6NNZ2 444 aa22.58■■□□□ 1.2
SYT6-210ENST00000641643 MUSKO15146 869 aa22.58■■□□□ 1.2
SYT6-210ENST00000641643 SPOPO43791 374 aa22.58■■□□□ 1.2
SYT6-210ENST00000641643 MMP20O60882 483 aa22.58■■□□□ 1.2
SYT6-210ENST00000641643 TM7SF2O76062 418 aa22.58■■□□□ 1.2
SYT6-210ENST00000641643 ITGAVP06756 1048 aa22.58■■□□□ 1.2
SYT6-210ENST00000641643 TNNT1P13805 278 aa22.58■■□□□ 1.2
SYT6-210ENST00000641643 FECHP22830 423 aa22.58■■□□□ 1.2
SYT6-210ENST00000641643 MMP13P45452 471 aa22.58■■□□□ 1.2
SYT6-210ENST00000641643 CLDN2P57739 230 aa22.58■■□□□ 1.2
SYT6-210ENST00000641643 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
SYT6-210ENST00000641643 FGL2Q14314 439 aa22.58■■□□□ 1.2
SYT6-210ENST00000641643 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.2
SYT6-210ENST00000641643 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.2
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