RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641250.1

5S_rRNA.29-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 107 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 C1orf74Q96LT6 269 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 DUSP23Q9BVJ7 150 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 USP29Q9HBJ7 922 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 EPB41L5Q9HCM4 733 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.56□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP6.56□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 GULP1Q9UBP9 304 aa6.56□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa6.56□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.56□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa6.55□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 TSPAN6O43657 245 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 PRAMEF10O60809 474 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 TCEA3O75764 348 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 FUCA1P04066 466 aa6.55□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CHRNB2P17787 502 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CSRP3P50461 194 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CLCN6P51797 869 aa6.55□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 FOXR2Q6PJQ5 311 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 RD3Q7Z3Z2 195 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 HID1Q8IV36 788 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 FBXO39Q8N4B4 442 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CCDC185Q8N715 623 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CCL4L1Q8NHW4 92 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 IL12RB2Q99665 862 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 EPAS1Q99814 870 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 FUCA2Q9BTY2 467 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.55□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CEP44Q9C0F1 390 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 MRPL40Q9NQ50 206 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 APEX2Q9UBZ4 518 aa6.55□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 DNAJC12Q9UKB3 198 aa6.55□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.55□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 TMEM202A6NGA9 273 aa6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 LRIG2O94898 1065 aa6.54□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ADRA1BP35368 520 aa6.54□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 PAK1Q13153 545 aa6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 SPIDRQ14159 915 aa6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 INPP5AQ14642 412 aa6.54□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 CYTH1Q15438 398 aa6.54□□□□□ -1.36
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5S_rRNA.29-201ENST00000641250 HS1BP3Q53T59 392 aa6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 MIIPQ5JXC2 388 aa6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 RETSATQ6NUM9 610 aa6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 GDPD4Q6W3E5 623 aa6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 MACC1Q6ZN28 852 aa6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.54□□□□□ -1.36
5S_rRNA.29-201ENST00000641250 TTC7BQ86TV6 843 aa6.54□□□□□ -1.36
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