RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639145.1

SCARB2-215, Transcript of scavenger receptor class B member 2, human

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCARB2, Length 4,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SCARB2-215	ENST00000639145	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	ZNF556	Q9HAH1	456 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	THAP1	Q9NVV9	213 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	AHSP	Q9NZD4	102 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	POLG2	Q9UHN1	485 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	CRYBG1	Q9Y4K1	1723 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	GLI3	P10071	1580 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	DNM1L	O00429	736 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	FFAR3	O14843	346 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	GPR42	O15529	346 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	RPA3	P35244	121 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	PSMD8	P48556	350 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	GPR15	P49685	360 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	CYLC2	Q14093	348 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	C2orf27A	Q580R0	203 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	TNS4	Q8IZW8	715 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	HMCES	Q96FZ2	354 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	SPACA7	Q96KW9	195 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	RCOR3	Q9P2K3	495 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	THEG	Q9P2T0	379 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	ASF1A	Q9Y294	204 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	HBS1L	Q9Y450	684 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	SASH3	O75995	380 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	CDK14	O94921	469 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	MLN	P12872	115 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	UNG	P13051	313 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	HPGD	P15428	266 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	PEX5	P50542	639 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	SEC13	P55735	322 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	IL27RA	Q6UWB1	636 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	LDB1	Q86U70	411 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	CRYBG2	Q8N1P7	616 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	PGM2	Q96G03	612 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	RMND5A	Q9H871	391 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	NMUR1	Q9HB89	426 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	CNTN3	Q9P232	1028 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	GNPTG	Q9UJJ9	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	ENPP3	O14638	875 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	DYRK3	O43781	588 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	OCM2	P0CE71	109 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	ZNF865	P0CJ78	1059 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	HFE2	Q6ZVN8	426 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	RNF148	Q8N7C7	305 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	PCDH19	Q8TAB3	1148 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	ZNF75CP	Q92670	426 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	PLEKHA8	Q96JA3	519 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	DACH2	Q96NX9	599 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	CHRAC1	Q9NRG0	131 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	RAD18	Q9NS91	495 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	SIX4	Q9UIU6	781 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	PCDHA11	Q9Y5I1	949 aa		13.72	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	SPEF2	Q9C093	1822 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	CD3EAP	O15446	510 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	KCNE1	P15382	129 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	CLCN5	P51795	746 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	CYP2A13	Q16696	494 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	PATL1	Q86TB9	770 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	HORMAD1	Q86X24	394 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	ZMAT2	Q96NC0	199 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	WRAP53	Q9BUR4	548 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	CCDC167	Q9P0B6	97 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	ITGB4	P16144	1822 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	FGF18	O76093	207 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	ITGA2B	P08514	1039 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	POLE2	P56282	527 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	TPGS2	Q68CL5	300 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	ART4	Q93070	314 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	PTPN18	Q99952	460 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	ABCB8	Q9NUT2	735 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	ARMCX1	Q9P291	453 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	EFR3B	Q9Y2G0	817 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	NR2E1	Q9Y466	385 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	CHD4	Q14839	1912 aa		13.71	□□□□□ -0.21
SCARB2-215	ENST00000639145	NDST3	O95803	873 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SCARB2-215	ENST00000639145	DGKG	P49619	791 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SCARB2-215	ENST00000639145	EIF2B5	Q13144	721 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.22
SCARB2-215	ENST00000639145	LRRC73	Q5JTD7	316 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SCARB2-215	ENST00000639145	CEP68	Q76N32	757 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SCARB2-215	ENST00000639145	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SCARB2-215	ENST00000639145	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SCARB2-215	ENST00000639145	TBATA	Q96M53	351 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SCARB2-215	ENST00000639145	CYLD	Q9NQC7	956 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SCARB2-215	ENST00000639145	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SCARB2-215	ENST00000639145	RAB23	Q9ULC3	237 aa		13.71	□□□□□ -0.22
SCARB2-215	ENST00000639145	HNRNPCL2	B2RXH8	293 aa		13.7	□□□□□ -0.22
SCARB2-215	ENST00000639145	SCAMP1	O15126	338 aa		13.7	□□□□□ -0.22

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.3 ms