RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000638390.1

PRRC2B-210, Transcript of proline rich coiled-coil 2B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRC2B, Length 1,084 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRC2B-210ENST00000638390 FEM1CQ96JP0 617 aa14.96□□□□□ -0.01
PRRC2B-210ENST00000638390 ANP32EQ9BTT0 268 aa14.96□□□□□ -0.01
PRRC2B-210ENST00000638390 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.96□□□□□ -0.01
PRRC2B-210ENST00000638390 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
PRRC2B-210ENST00000638390 TM7SF3Q9NS93 570 aa14.96□□□□□ -0.01
PRRC2B-210ENST00000638390 IMPACTQ9P2X3 320 aa14.96□□□□□ -0.01
PRRC2B-210ENST00000638390 GGT7Q9UJ14 662 aa14.96□□□□□ -0.01
PRRC2B-210ENST00000638390 ITM2BQ9Y287 266 aa14.96□□□□□ -0.01
PRRC2B-210ENST00000638390 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PRRC2B-210ENST00000638390 C3orf70A6NLC5 250 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 H0Y8X5 98 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 TLR4O00206 839 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 GIPC1O14908 333 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 SLC31A1O15431 190 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 DFNA5O60443 496 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 ADRB1P08588 477 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 TIMP2P16035 220 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 CR2P20023 1033 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 COMTP21964 271 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 SERPINA4P29622 427 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 AKT2P31751 481 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 GARSP41250 739 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 AP1S1P61966 158 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 ZNF235Q14590 738 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 STAT4Q14765 748 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 BRAT1Q6PJG6 821 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 RAD9BQ6WBX8 426 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 DBX2Q6ZNG2 339 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 TTC7BQ86TV6 843 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 TMEM139Q8IV31 216 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 NAXDQ8IW45 347 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 RHOT1Q8IXI2 618 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 ASB12Q8WXK4 309 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 ECHDC3Q96DC8 303 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 RNF157Q96PX1 679 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 MGME1Q9BQP7 344 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 SLC32A1Q9H598 525 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 FZD3Q9NPG1 666 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 GDF3Q9NR23 364 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 TFR2Q9UP52 801 aa14.95□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 A0A1B0GTQ1 180 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 LRRD1A4D1F6 860 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 KCNK3O14649 394 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 SH3BP5O60239 455 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 MAGEC1O60732 1142 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 KRT1P04264 644 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 KCNA4P22459 653 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 CCT8P50990 548 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 GBE1Q04446 702 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 BCL2L1Q07817 233 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 ELP6Q0PNE2 266 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 LRRC73Q5JTD7 316 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 SLC9A4Q6AI14 798 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 C11orf63Q6NUN7 778 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 GCNT7Q6ZNI0 430 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 BBS5Q8N3I7 341 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 PGBD5Q8N414 524 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 TEX26Q8N6G2 289 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 MAML1Q92585 1016 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 FATE1Q969F0 183 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 TSGA13Q96PP4 275 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 NUDCD1Q96RS6 583 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 MYOCQ99972 504 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 CA5BQ9Y2D0 317 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 HYOU1Q9Y4L1 999 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 ALG6Q9Y672 507 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 TMEM131Q92545 1883 aa14.94□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 RCCD1A6NED2 376 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 IGLON5A6NGN9 336 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 NEMP1O14524 444 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 FLRT2O43155 660 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 PSTPIP1O43586 416 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 SPOPO43791 374 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 PCDHGA12O60330 932 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 MMP13P45452 471 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 SCNN1BP51168 640 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 SHBQ15464 509 aa14.93□□□□□ -0.02
PRRC2B-210ENST00000638390 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms