RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637132.1

CACNB4-241, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, humanhuman

TSL 5

Gene CACNB4, Length 3,877 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB4-241ENST00000637132 MED19A0JLT2 244 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 TRIM49BA6NDI0 452 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 OR5K4A6NMS3 321 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 H7C0C1 242 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 LILRB5O75023 590 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 PPFIA2O75334 1257 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 MT-CO3P00414 261 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 ABHD2P08910 425 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 ALDH4A1P30038 563 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 SOX5P35711 763 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 ATP5OP48047 213 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 FANCCQ00597 558 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 DNAJC3Q13217 504 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 PKP1Q13835 747 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 NAB2Q15742 525 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 CYP1B1Q16678 543 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 LONRF2Q1L5Z9 754 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 KIF19Q2TAC6 998 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 PARP15Q460N3 678 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 ARSIQ5FYB1 569 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 MSANTD2Q6P1R3 559 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 EMBQ6PCB8 327 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 BRAT1Q6PJG6 821 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 SLC26A9Q7LBE3 791 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 IQCHQ86VS3 1027 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 TRIM59Q8IWR1 403 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 TEX19Q8NA77 164 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 SLC35C1Q96A29 364 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 WDR92Q96MX6 357 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 CRISPLD1Q9H336 500 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 TM9SF3Q9HD45 589 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 SENP1Q9P0U3 644 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 GPR34Q9UPC5 381 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 NAALADL1Q9UQQ1 740 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 MSRB2Q9Y3D2 182 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 PKP3Q9Y446 797 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 MRFAP1Q9Y605 127 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 A0A1W2PPC4 97 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 MCF2LO15068 1137 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 MUSKO15146 869 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 HADHAP40939 763 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 FNTAP49354 379 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 AP1S1P61966 158 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 YPEL5P62699 121 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 SCAPQ12770 1279 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 GEN1Q17RS7 908 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 SLC25A52Q3SY17 297 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 TEX35Q5T0J7 233 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 TRIM65Q6PJ69 517 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 C19orf48Q6RUI8 117 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 GDPD4Q6W3E5 623 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 Q6ZVU0 165 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 C14orf80Q86SX3 495 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 TAC4Q86UU9 113 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 PARGQ86W56 976 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 GAS2L3Q86XJ1 694 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 GATAD2AQ86YP4 633 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 RFX6Q8HWS3 928 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 TBC1D19Q8N5T2 526 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 KIAA0895Q8NCT3 520 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 FAM172AQ8WUF8 416 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 KLHL32Q96NJ5 620 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 FSD1LQ9BXM9 530 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 CEP44Q9C0F1 390 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 PADI4Q9UM07 663 aa3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 LNP1A1A4G5 178 aa3.68□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 LRRD1A4D1F6 860 aa3.68□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 WASH3PC4AMC7 463 aa3.68□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 C9J4A7 227 aa3.68□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 PEX12O00623 359 aa3.68□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 ABLIM1O14639 778 aa3.68□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 VILLO15195 856 aa3.68□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 STX7O15400 261 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 PSTPIP1O43586 416 aa3.68□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 KIF5CO60282 957 aa3.68□□□□□ -1.82
CACNB4-241ENST00000637132 GDF9O60383 454 aa3.68□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.9 ms