RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636839.1

CLN3-250, Transcript of CLN3, battenin, humanhuman

TSL 5

Gene CLN3, Length 2,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3-250ENST00000636839 VPS18Q9P253 973 aa20.31■□□□□ 0.84
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CLN3-250ENST00000636839 A0A1W2PPC1 479 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN3-250ENST00000636839 TCEA3O75764 348 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN3-250ENST00000636839 ERVK-10P10266 1014 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN3-250ENST00000636839 TSHRP16473 764 aa20.31■□□□□ 0.84
CLN3-250ENST00000636839 DGKGP49619 791 aa20.31■□□□□ 0.84
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CLN3-250ENST00000636839 ECT2LQ008S8 904 aa20.31■□□□□ 0.84
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CLN3-250ENST00000636839 GOLGA8TH3BQL2 631 aa20.3■□□□□ 0.84
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CLN3-250ENST00000636839 MTG2Q9H4K7 406 aa20.3■□□□□ 0.84
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CLN3-250ENST00000636839 CD207Q9UJ71 328 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN3-250ENST00000636839 TCAF1Q9Y4C2 921 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN3-250ENST00000636839 SPO11Q9Y5K1 396 aa20.28■□□□□ 0.84
CLN3-250ENST00000636839 TTC34A8MYJ7 566 aa20.27■□□□□ 0.84
CLN3-250ENST00000636839 AURKAO14965 403 aa20.27■□□□□ 0.84
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