RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636751.2

TCF4-280, Transcript of transcription factor 4, human

TSL 5

Gene TCF4, Length 8,283 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF4-280	ENST00000636751	GPM6B	Q13491	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CAMK2D	Q13557	499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC41	Q15345	812 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PSMD5	Q16401	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RTP2	Q5QGT7	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CDCA2	Q69YH5	1023 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	IL31	Q6EBC2	164 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	C14orf80	Q86SX3	495 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TTC7B	Q86TV6	843 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SUSD6	Q92537	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	AZIN2	Q96A70	460 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZFP42	Q96MM3	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MYL10	Q9BUA6	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	VRTN	Q9H8Y1	702 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PAK5	Q9P286	719 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SNX8	Q9Y5X2	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ALG6	Q9Y672	507 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SGTA	O43765	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SIN3B	O75182	1162 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PSMD10	O75832	226 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SERPINA3	P01011	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PENK	P01210	267 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CYBA	P13498	195 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CYP11B1	P15538	503 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	JUND	P17535	347 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	VEGFB	P49765	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SERPINB9	P50453	376 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DGUOK	Q16854	277 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FRA10AC1	Q70Z53	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SERINC5	Q86VE9	423 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PRCC	Q92733	491 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SYT15	Q9BQS2	421 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	REEP2	Q9BRK0	252 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	AIFM2	Q9BRQ8	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	UBE2T	Q9NPD8	197 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SLC2A4RG	Q9NR83	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	XPO7	Q9UIA9	1087 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GGT7	Q9UJ14	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	VPS4A	Q9UN37	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EPN1	Q9Y6I3	576 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ASTN1	O14525	1302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751		A0A1W2PQY0	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	URAD	A6NGE7	173 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF487	B1APH4	448 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	AKAP8	O43823	692 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ATF2	P15336	505 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MAPKAPK2	P49137	400 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	LRRC74A	Q0VAA2	488 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	BORA	Q6PGQ7	559 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FBXO38	Q6PIJ6	1188 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PACS1	Q6VY07	963 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RGL4	Q8IZJ4	473 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	DGCR14	Q96DF8	476 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RNF31	Q96EP0	1072 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SERPINI1	Q99574	410 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PRPF18	Q99633	342 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	P2RY13	Q9BPV8	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	LNPEP	Q9UIQ6	1025 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CRYL1	Q9Y2S2	319 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FAM187A	A6NFU0	413 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MEIS2	O14770	477 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ZNF217	O75362	1048 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CLDN11	O75508	207 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ATG7	O95352	703 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	MLLT6	P55198	1093 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CLCA4	Q14CN2	919 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	C11orf63	Q6NUN7	778 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CORO6	Q6QEF8	472 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	CRELD2	Q6UXH1	353 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	C15orf39	Q6ZRI6	1047 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	GJD3	Q8N144	294 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	PSMA8	Q8TAA3	256 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	FAR2	Q96K12	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EPC1	Q9H2F5	836 aa		4.86	□□□□□ -1.63
TCF4-280	ENST00000636751	EML4	Q9HC35	981 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63

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