RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 PISDQ9UG56 409 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 NAV2Q8IVL1 2488 aa27.75■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 TMX2-CTNND1H3BSU7 103 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 AGRPO00253 132 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 TM7SF2O76062 418 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 BLKP51451 505 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00303Q3SY05 128 aa27.74■■■□□ 2.03
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CAPNS1-217ENST00000629983 OR2AP1Q8NGE2 309 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 C18orf8Q96DM3 657 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 EPAS1Q99814 870 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa27.74■■■□□ 2.03
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CAPNS1-217ENST00000629983 DNAJC12Q9UKB3 198 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 HPCAL4Q9UM19 191 aa27.74■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SPTA1P02549 2419 aa27.73■■■□□ 2.03
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CAPNS1-217ENST00000629983 CD160O95971 181 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 GSRP00390 522 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ALPIP09923 528 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 FLT3P36888 993 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 CCL7P80098 99 aa27.73■■■□□ 2.03
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CAPNS1-217ENST00000629983 PLPP6Q8IY26 295 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 CFAP57Q96MR6 1250 aa27.73■■■□□ 2.03
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CAPNS1-217ENST00000629983 GPR34Q9UPC5 381 aa27.73■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
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CAPNS1-217ENST00000629983 CLCN1P35523 988 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 KLHL40Q2TBA0 621 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 MYLK3Q32MK0 819 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ATG14Q6ZNE5 492 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF354CQ86Y25 554 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM74Q96NL1 305 aa27.72■■■□□ 2.03
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CAPNS1-217ENST00000629983 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 DNAI1Q9UI46 699 aa27.72■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 TOR1BO14657 336 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 AREL1O15033 823 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 SCNN1AP37088 669 aa27.71■■■□□ 2.03
CAPNS1-217ENST00000629983 BPIFB4P59827 614 aa27.71■■■□□ 2.03
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CAPNS1-217ENST00000629983 GDPD4Q6W3E5 623 aa27.71■■■□□ 2.03
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CAPNS1-217ENST00000629983 LIPCP11150 499 aa27.7■■■□□ 2.02
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CAPNS1-217ENST00000629983 HK3P52790 923 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP11AP98196 1134 aa27.7■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 RAD51Q06609 339 aa27.7■■■□□ 2.02
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CAPNS1-217ENST00000629983 TRNP1Q6NT89 227 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa27.68■■■□□ 2.02
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CAPNS1-217ENST00000629983 STARD5Q9NSY2 213 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 OR12D3Q9UGF7 316 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 COQ6Q9Y2Z9 468 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 KIF26BQ2KJY2 2108 aa27.68■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa27.67■■■□□ 2.02
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa27.67■■■□□ 2.02
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