RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625905.1

NELFE-214, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NELFE, Length 111 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-214ENST00000625905 CST8O60676 142 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 GJB3O75712 270 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 FTCDO95954 541 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PTMAP06454 111 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SYPP08247 313 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 KRT10P13645 584 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ENGP17813 658 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TGM2P21980 687 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CCNCP24863 283 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 NUDT1P36639 197 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 GRIA4P48058 902 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 RWDD2BP57060 319 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 MAXP61244 160 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 IRX4P78413 519 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 BCL2L1Q07817 233 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 GRIK2Q13002 908 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PDK1Q15118 436 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 LLGL1Q15334 1064 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TAZQ16635 292 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 LRRC73Q5JTD7 316 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 BRAT1Q6PJG6 821 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 LAYNQ6UX15 382 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 NPNTQ6UXI9 565 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PRPF39Q86UA1 669 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 NT5DC3Q86UY8 548 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ZSCAN30Q86W11 494 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 HORMAD1Q86X24 394 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CAMK1DQ8IU85 385 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 RCOR2Q8IZ40 523 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PGBD5Q8N414 524 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 UBL4BQ8N7F7 174 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 LRRN4Q8WUT4 740 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 MAML1Q92585 1016 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 FATE1Q969F0 183 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 VOPP1Q96AW1 172 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SERAC1Q96JX3 654 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 OLFM3Q96PB7 478 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TSGA13Q96PP4 275 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ALS2CR12Q96Q35 445 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 NUDCD1Q96RS6 583 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ORAI3Q9BRQ5 295 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CAPN10Q9HC96 672 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TM9SF3Q9HD45 589 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 NT5MQ9NPB1 228 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 FSCN3Q9NQT6 498 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 RXFP3Q9NSD7 469 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 DKK3Q9UBP4 350 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 AMFRQ9UKV5 643 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 GUCA1BQ9UMX6 200 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 DMTF1Q9Y222 760 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ITM2BQ9Y287 266 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 FADS3Q9Y5Q0 445 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa9.32□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ANKRD36A6QL64 1941 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 GON4LQ3T8J9 2241 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 C10orf142B7Z368 130 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 KCNK1O00180 336 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 MATN3O15232 486 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SPINT1O43278 529 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 TSPAN6O43657 245 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 GDF9O60383 454 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SOCS5O75159 536 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 HLA-DQB2P05538 268 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CCNB1P14635 433 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 PRLRP16471 622 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CR2P20023 1033 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SDHBP21912 280 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CETN2P41208 172 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 NR2C2P49116 596 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SUOXP51687 545 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 C21orf59P57076 290 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 COPS2P61201 443 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 RPS21P63220 83 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 RACK1P63244 317 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ITKQ08881 620 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ELP6Q0PNE2 266 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 AP1B1Q10567 949 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ZNF284Q2VY69 593 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SLC45A4Q5BKX6 768 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 RALGPS1Q5JS13 557 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 CCDC181Q5TID7 509 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 SEL1L3Q68CR1 1132 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 ERAP2Q6P179 960 aa9.31□□□□□ -0.92
NELFE-214ENST00000625905 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms