RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000620631.4

GTF2I-217, Transcript of general transcription factor IIi, humanhuman

TSL 2

Gene GTF2I, Length 868 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2I-217ENST00000620631 GDAQ9Y2T3 454 aa5.97□□□□□ -1.45
GTF2I-217ENST00000620631 MED16Q9Y2X0 877 aa5.97□□□□□ -1.45
GTF2I-217ENST00000620631 RAD54BQ9Y620 910 aa5.97□□□□□ -1.45
GTF2I-217ENST00000620631 MYH15Q9Y2K3 1946 aa5.97□□□□□ -1.45
GTF2I-217ENST00000620631 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa5.97□□□□□ -1.45
GTF2I-217ENST00000620631 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
GTF2I-217ENST00000620631 VCANP13611 3396 aa5.97□□□□□ -1.45
GTF2I-217ENST00000620631 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.45
GTF2I-217ENST00000620631 NLRC5Q86WI3 1866 aa5.96□□□□□ -1.45
GTF2I-217ENST00000620631 ARL5CA6NH57 179 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 MYMKA6NI61 221 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 TISP43B9A030 160 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 K7ENM7 598 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 K7ERI5 159 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 PER2O15055 1255 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 LINC01565O15544 149 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 TBCAO75347 108 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 TUSC2O75896 110 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 FGF18O76093 207 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 DDHD2O94830 711 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 YEATS4O95619 227 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 THP07101 528 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 EBLN1P0CF75 366 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 NDUFB7P17568 137 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 CASP1P29466 404 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 CD6P30203 668 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 NMT1P30419 496 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 SLC11A1P49279 550 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 FOXF2Q12947 444 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 CAMK1Q14012 370 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 GIT2Q14161 759 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 TBCCQ15814 346 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 GLRA4Q5JXX5 417 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 ATF7IP2Q5U623 682 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 PLPP4Q5VZY2 271 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 SLC27A1Q6PCB7 646 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 SHC4Q6S5L8 630 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 SFR1Q86XK3 245 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 TCEAL8Q8IYN2 117 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 MYCT1Q8N699 235 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 SPPL3Q8TCT6 385 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 URGCPQ8TCY9 931 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 HASPINQ8TF76 798 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 POF1BQ8WVV4 589 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 BICD1Q96G01 975 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 ZNF558Q96NG5 402 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 ALG8Q9BVK2 526 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 NFKBIZQ9BYH8 718 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 CCSER1Q9C0I3 900 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 CDT1Q9H211 546 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 FZD8Q9H461 694 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 MIOSQ9NXC5 875 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 EHD3Q9NZN3 535 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 HESX1Q9UBX0 185 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 PCDHA7Q9UN72 937 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 PRG3Q9Y2Y8 225 aaPredicted RBP5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 MYO9BQ13459 2157 aa5.96□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 A0A1B0GUA9 196 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 CASTOR2A6NHX0 329 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 C5orf67F2Z3F1 127 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 H3BQ06 376 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 M0QYG6 137 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 ACKR2O00590 384 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 PTGESO14684 152 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 SCGB1D2O95969 90 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 RB1P06400 928 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 MYBP10242 640 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 IDEP14735 1019 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 AXLP30530 894 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 DDIT3P35638 169 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 OR1G1P47890 313 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 CCT8P50990 548 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 EFNA5P52803 228 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 PROK1P58294 105 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 POU5F1BQ06416 359 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 HYAL1Q12794 435 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 BOP1Q14137 746 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 FAM187BQ17R55 369 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 MINDY4Q4G0A6 757 aa5.95□□□□□ -1.46
GTF2I-217ENST00000620631 FCRLBQ6BAA4 426 aa5.95□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms