RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608295.5

HDDC2-204, Transcript of HD domain containing 2, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HDDC2, Length 879 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC2-204ENST00000608295 TMEM259Q4ZIN3 620 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC2-204ENST00000608295 ZNF542PQ5EBM4 170 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC2-204ENST00000608295 TMCO4Q5TGY1 634 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC2-204ENST00000608295 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC2-204ENST00000608295 ZSWIM9Q86XI8 627 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC2-204ENST00000608295 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC2-204ENST00000608295 RFFLQ8WZ73 363 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC2-204ENST00000608295 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC2-204ENST00000608295 SLC17A9Q9BYT1 436 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC2-204ENST00000608295 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa14.65□□□□□ -0.06
HDDC2-204ENST00000608295 A0A1B0GTQ1 180 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SOWAHDA6NJG2 315 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 A8MX80 341 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PMLP29590 882 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SERPINB6P35237 376 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 HCAR3P49019 387 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 RPS21P63220 83 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 BNIP3Q12983 259 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 LLGL1Q15334 1064 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SHBQ15464 509 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 TCEA2Q15560 299 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SRLQ86TD4 932 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MFSD2AQ8NA29 543 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PCDH19Q8TAB3 1148 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 RAPGEF5Q92565 580 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 TSC1Q92574 1164 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 FEM1CQ96JP0 617 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 NSMCE3Q96MG7 304 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.64□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 POM121BA6NF01 834 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 UPK3BL1B0FP48 263 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 UPK3BL2E5RIL1 263 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 FLRT2O43155 660 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MAFKO60675 156 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ITGAVP06756 1048 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 TIMP2P16035 220 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 IL4RP24394 825 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 NOP2P46087 812 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ARSEP51690 589 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ZNF135P52742 658 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 DYNLT1P63172 113 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SGCGQ13326 291 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SLC14A1Q13336 389 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 RHOT2Q8IXI1 618 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PLPP6Q8IY26 295 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PGBD5Q8N414 524 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 LZTR1Q8N653 840 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SPC24Q8NBT2 197 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 TMEM145Q8NBT3 493 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 LRIG1Q96JA1 1093 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SUV39H2Q9H5I1 410 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 NT5MQ9NPB1 228 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PCDH12Q9NPG4 1184 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SEPT3Q9UH03 358 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa14.63□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 A6NNZ2 444 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SCAMP1O15126 338 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 FFAR2O15552 330 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 TSPAN6O43657 245 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 AP1G1O43747 822 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SPOPO43791 374 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 KRT7P08729 469 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 FTH1P19P0C7X4 201 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ZNF883P0CG24 379 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SERPINA4P29622 427 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 IGFALSP35858 605 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 GRK6P43250 576 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 MAGEA1P43355 309 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ARRB1P49407 418 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 GBE1Q04446 702 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 BCL2L1Q07817 233 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ITKQ08881 620 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 TPRG1LQ5T0D9 272 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 NEK5Q6P3R8 708 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 Q6ZSR6 202 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 EID2Q8N6I1 236 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 NSMCE1Q8WV22 266 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 ZNF670Q9BS34 389 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 SCUBE2Q9NQ36 999 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 FTSJ1Q9UET6 329 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 KLK13Q9UKR3 277 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa14.62□□□□□ -0.07
HDDC2-204ENST00000608295 AREL1O15033 823 aa14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms