RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 TBATAQ96M53 351 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC3Q9BQI4 270 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 HPCAL4Q9UM19 191 aa25.99■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 YY2O15391 372 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 RAMP2O60895 175 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 GJB6O95452 261 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ANXA6P08133 673 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CELA2BP08218 269 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 TSHRP16473 764 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 GDPD4Q6W3E5 623 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 MACC1Q6ZN28 852 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC185Q8N715 623 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 NETO2Q8NC67 525 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 GPT2Q8TD30 523 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 GLMNQ92990 594 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 NAT6Q93015 286 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 TBC1D31Q96DN5 1066 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 EPAS1Q99814 870 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC13A1Q9BZW2 595 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 RETREG1Q9H6L5 497 aa25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 K7ENP7 123 aa25.97■■□□□ 1.75
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CAPNS1-211ENST00000590874 TM7SF2O76062 418 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 TMCC1O94876 653 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 SDC4P31431 198 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 UBE2HP62256 183 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 YPEL5P62699 121 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 DPCR1Q3MIW9 517 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 FAXCQ5TGI0 409 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP25.97■■□□□ 1.75
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CAPNS1-211ENST00000590874 CXorf40AQ8TE69 158 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 STK33Q9BYT3 514 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 PADI4Q9UM07 663 aa25.97■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 C2CD4BA6NLJ0 364 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 KDELR3O43731 214 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 TNFSF15O95150 251 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 MMP8P22894 467 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 HDAC4P56524 1084 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CLN3Q13286 438 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 KLHL40Q2TBA0 621 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CLEC14AQ86T13 490 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL14Q8N4G2 192 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa25.96■■□□□ 1.75
CAPNS1-211ENST00000590874 C11orf70Q9BRQ4 267 aa25.96■■□□□ 1.75
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CAPNS1-211ENST00000590874 SPIDRQ14159 915 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 IRF4Q15306 451 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 STRADAQ7RTN6 431 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 SLC30A5Q8TAD4 765 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 WDR48Q8TAF3 677 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 TTYH3Q9C0H2 523 aa25.95■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 KLC2Q9H0B6 622 aa25.95■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 CCDC187A0A096LP49 1063 aa25.94■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 GFPT2O94808 682 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 TIMP2P16035 220 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 CHRNB2P17787 502 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 PTPN9P43378 593 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 FMO1Q01740 532 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 TCEA2Q15560 299 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF354CQ86Y25 554 aa25.94■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 KYQ8NBH2 561 aa25.94■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 RABGEF1Q9UJ41 708 aa25.94■■□□□ 1.74
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CAPNS1-211ENST00000590874 TOR1BO14657 336 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 INSIG1O15503 277 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 C6P13671 934 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 CDR2Q01850 454 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF677Q86XU0 584 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ARL10Q8N8L6 244 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 PCDH19Q8TAB3 1148 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 GANQ9H2C0 597 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 DKK3Q9UBP4 350 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 GULP1Q9UBP9 304 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa25.93■■□□□ 1.74
CAPNS1-211ENST00000590874 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
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