RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589631.5

GIPC1-211, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3

Gene GIPC1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-211ENST00000589631 DNAJC7Q99615 494 aa20.43■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 ANKRD36A6QL64 1941 aa20.43■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 INSIG1O15503 277 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 PALMO75781 387 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 LDOC1O95751 146 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 TIMP2P16035 220 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 SLC18A3Q16572 532 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 Q6ZSR6 202 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 EID2Q8N6I1 236 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 DENND6BQ8NEG7 585 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 BTBD6Q96KE9 485 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 EXOC2Q96KP1 924 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 SP110Q9HB58 689 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 GPR27Q9NS67 375 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 GGT7Q9UJ14 662 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 ITM2BQ9Y287 266 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 CACNA1BQ00975 2339 aa20.42■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 TSPAN11A1L157 253 aa20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM8BA6NDV4 472 aa20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 POM121BA6NF01 834 aa20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 DFFAO00273 331 aa20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 RAD51BO15315 384 aa20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 HSPH1Q92598 858 aa20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 CALN1Q9BXU9 219 aa20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa20.41■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 ENC1O14682 589 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 FPGTO14772 594 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 AMPD1P23109 780 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 RABIFP47224 123 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 KNTC1P50748 2209 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 ELP6Q0PNE2 266 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 HADHQ16836 314 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 LRRK1Q38SD2 2015 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 SRLQ86TD4 932 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 VSTM4Q8IW00 320 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 CENPTQ96BT3 561 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 ZNF599Q96NL3 588 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 UVRAGQ9P2Y5 699 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 LCMT1Q9UIC8 334 aa20.4■□□□□ 0.86
GIPC1-211ENST00000589631 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 PIGNO95427 931 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 TPM1P09493 284 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 C1SP09871 688 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 H2AFZP0C0S5 128 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 CDK4P11802 303 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 XPAP23025 273 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 DGKAP23743 735 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 RGRP47804 291 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 RENBPP51606 427 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 UGP2Q16851 508 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 H2AFVQ71UI9 128 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 SLC25A45Q8N413 288 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 FAM71BQ8TC56 605 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 CXorf40AQ8TE69 158 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 TSC1Q92574 1164 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 PSKH2Q96QS6 385 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 ETNK2Q9NVF9 386 aa20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 GOLGA4Q13439 2230 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP20.38■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 SHROOM3Q8TF72 1996 aa20.38■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 MMP20O60882 483 aa20.38■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 TM7SF2O76062 418 aa20.38■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 ITIH2P19823 946 aa20.38■□□□□ 0.85
GIPC1-211ENST00000589631 PFN3P60673 137 aa20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.7 ms