RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588477.5

IFT20-216, Transcript of intraflagellar transport 20, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene IFT20, Length 774 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT20-216ENST00000588477 PRAMEF10O60809 474 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 MMP20O60882 483 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 PPFIA2O75334 1257 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 TM7SF2O76062 418 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 F9P00740 461 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 UGT2B4P06133 528 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ALPIP09923 528 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 CCKBRP32239 447 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 BLKP51451 505 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 SNX16P57768 344 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 TLE1Q04724 770 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 KLHL40Q2TBA0 621 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 PTPN20Q4JDL3 420 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 RD3Q7Z3Z2 195 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 TTC7BQ86TV6 843 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ZFAND4Q86XD8 727 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 HID1Q8IV36 788 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 PLPP6Q8IY26 295 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 DRC7Q8IY82 874 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 NELFBQ8WX92 580 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 NT5C3BQ969T7 300 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ARHGEF26Q96DR7 871 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 CRACR2AQ9BSW2 395 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 EDEM3Q9BZQ6 932 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ZYG11BQ9C0D3 744 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 GPR34Q9UPC5 381 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 LOXL2Q9Y4K0 774 aa15.49■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 TOR1BO14657 336 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 AREL1O15033 823 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 WT1P19544 449 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 SLC9A1P19634 815 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ITIH2P19823 946 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ACVRL1P37023 503 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ETV5P41161 510 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 PPP1R2P41236 205 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 HK3P52790 923 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 MAPK10P53779 464 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 MARSP56192 900 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 APBA1Q02410 837 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 TRIM65Q6PJ69 517 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 LVRNQ6Q4G3 990 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 CXorf40AQ8TE69 158 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 EPAS1Q99814 870 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 SLC25A18Q9H1K4 315 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 PLCB1Q9NQ66 1216 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ANKMY1Q9P2S6 941 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 CTNND2Q9UQB3 1225 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa15.48■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 BICDL2A1A5D9 508 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 POP4O95707 220 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 GNA14O95837 355 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 KRT9P35527 623 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 STX17P56962 302 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 PTK2Q05397 1052 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 CLCA4Q14CN2 919 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 SLC25A52Q3SY17 297 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ENPP7Q6UWV6 458 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 LEKR1Q6ZMV7 388 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 NYAP1Q6ZVC0 841 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 GKN2Q86XP6 184 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 OR6C4Q8NGE1 309 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 OR2AP1Q8NGE2 309 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 HTR3CQ8WXA8 447 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 USP7Q93009 1102 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 VOPP1Q96AW1 172 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 FAM81BQ96LP2 452 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 HAPLN3Q96S86 360 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 FOXJ2Q9P0K8 574 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 SEPT3Q9UH03 358 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 MAN1B1Q9UKM7 699 aa15.47■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 FAM170AA1A519 330 aa15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 RASGRP1O95267 797 aa15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 GSRP00390 522 aa15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 NTRK1P04629 796 aa15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 PEX5P50542 639 aa15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 IRF4Q15306 451 aa15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ALG11Q2TAA5 492 aa15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 MYLK3Q32MK0 819 aa15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 ATXN7L2Q5T6C5 722 aaPredicted RBP15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 GDPD4Q6W3E5 623 aa15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 DTX1Q86Y01 620 aa15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 CCNJLQ8IV13 435 aa15.46■□□□□ 0.07
IFT20-216ENST00000588477 SHC3Q92529 594 aa15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.7 ms