RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588345.1

CTIF-206, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 3

Gene CTIF, Length 584 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-206ENST00000588345 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP18.51■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 IGSF10Q6WRI0 2623 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TSPAN11A1L157 253 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TOR1BO14657 336 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TEX33O43247 280 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 OPA1O60313 960 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 NEBLO76041 1014 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TM7SF2O76062 418 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TIMP2P16035 220 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 DESP17661 470 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 IGFALSP35858 605 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 ABCG1P45844 678 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 NDST2P52849 883 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 SEMG2Q02383 582 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 MAMLD1Q13495 774 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 PTK2BQ14289 1009 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 CYTH1Q15438 398 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 BTN2A2Q8WVV5 523 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TBATAQ96M53 351 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 BPIFA3Q9BQP9 254 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 DONSONQ9NYP3 566 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 SALL4Q9UJQ4 1053 aa18.5■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 LRRK1Q38SD2 2015 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TPP1O14773 563 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 AQP9O43315 295 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 MMP20O60882 483 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 JUNDP17535 347 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TNFAIP3P21580 790 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TPI1P60174 286 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 YPEL5P62699 121 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 GRM3Q14832 879 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TMEM52BQ4KMG9 183 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 KDM7AQ6ZMT4 941 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 NETO2Q8NC67 525 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 DCBLD2Q96PD2 775 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 PARVAQ9NVD7 372 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 COL27A1Q8IZC6 1860 aaPredicted RBP18.49■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 ASXL3Q9C0F0 2248 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 INSIG1O15503 277 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 BRINP1O60477 761 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 PRAMEF11O60813 436 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 MYF5P13349 255 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 ITIH2P19823 946 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 THOP1P52888 689 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 ELP6Q0PNE2 266 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 LRRC73Q5JTD7 316 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 VPS36Q86VN1 386 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 DNAAF5Q86Y56 855 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 CXorf40AQ8TE69 158 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 DEPDC7Q96QD5 511 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 AP4E1Q9UPM8 1137 aa18.48■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 LRRC53A6NM62 1247 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 PSMA2P25787 234 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 CA9Q16790 459 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 KLHL40Q2TBA0 621 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TBC1D25Q3MII6 688 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 MACC1Q6ZN28 852 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 RBFAQ8N0V3 343 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 IFI44Q8TCB0 444 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 LMX1AQ8TE12 382 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 FNIP1Q8TF40 1166 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 FGF11Q92914 225 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 CRELD1Q96HD1 420 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 EXOC2Q96KP1 924 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 SUV39H2Q9H5I1 410 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 AIPL1Q9NZN9 384 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 SPASTQ9UBP0 616 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa18.47■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TMEM191CA6NGB0 347 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 TMCO5BA8MYB1 307 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 J3KR12 359 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 PIGNO95427 931 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 GZMAP12544 262 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 ITPKBP27987 946 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 ACTN2P35609 894 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 PRKCIP41743 596 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 CSNK1DP48730 415 aa18.46■□□□□ 0.55
CTIF-206ENST00000588345 AGERQ15109 404 aa18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.5 ms