RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579815.1

CLTC-211, Transcript of clathrin heavy chain, humanhuman

TSL 5

Gene CLTC, Length 609 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTC-211ENST00000579815 SLURP1P55000 103 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 GJA9P57773 515 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PARP6Q2NL67 630 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SLC25A52Q3SY17 297 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 STEAP4Q687X5 459 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 C1orf228Q6PIY5 440 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 NPNTQ6UXI9 565 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ASRGL1Q7L266 308 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 BNIPLQ7Z465 357 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CCDC91Q7Z6B0 441 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 RPAINQ86UA6 219 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 LRRC6Q86X45 466 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 C12orf29Q8N999 325 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 NETO2Q8NC67 525 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 KREMEN2Q8NCW0 462 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CFAP61Q8NHU2 1237 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 GSDMBQ8TAX9 411 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ACMSDQ8TDX5 336 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 TFB1MQ8WVM0 346 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 C10orf82Q8WW14 230 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ZNF75CPQ92670 426 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 RELTQ969Z4 430 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 NTAN1Q96AB6 310 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 KLHL29Q96CT2 875 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 OLFM3Q96PB7 478 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 TMEM237Q96Q45 408 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SPATA25Q9BR10 227 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 DUSP16Q9BY84 665 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 IQCGQ9H095 443 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 BRD8Q9H0E9 1235 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 FAM49AQ9H0Q0 323 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 AP5M1Q9H0R1 490 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 POPDC2Q9HBU9 364 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SAR1AQ9NR31 198 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ARHGEF3Q9NR81 526 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 FZD10Q9ULW2 581 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa6.46□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 TRPM7Q96QT4 1865 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 A0A1W2PPM1 405 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ARHGEF37A1IGU5 675 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 FAM159BA6NKW6 160 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 AP3B1O00203 1094 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 COPEO14579 308 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 GABRDO14764 452 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PPEF2O14830 753 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 NCAM2O15394 837 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 MTSS1O43312 755 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ATP2C2O75185 946 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 BANF1O75531 89 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 GRAP2O75791 330 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 DGKIO75912 1065 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ATP6V1G2O95670 118 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 LCP1P13796 627 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 EZRP15311 586 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ADORA2BP29275 332 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 RGS2P41220 211 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ECI1P42126 302 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 GRIA2P42262 883 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ETV4P43268 484 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 LHX1P48742 406 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SULT1E1P49888 294 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 KRTAP10-2P60368 255 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PPARDQ03181 441 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SCAPQ12770 1279 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.381e-5■■■□□ 16.7
CLTC-211ENST00000579815 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PDK1Q15118 436 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SLC1A5Q15758 541 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CA9Q16790 459 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa6.45□□□□□ -1.38
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CLTC-211ENST00000579815 UBXN11Q5T124 520 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 STXBP5Q5T5C0 1151 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 FAM91A1Q658Y4 838 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ATG16L1Q676U5 607 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 LIPIQ6XZB0 460 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 TIFABQ6ZNK6 161 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 RSPH3Q86UC2 560 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 ECHDC2Q86YB7 292 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 SCML4Q8N228 414 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 FITM2Q8N6M3 262 aa6.45□□□□□ -1.38
CLTC-211ENST00000579815 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa6.45□□□□□ -1.38
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