RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CA12O43570 354 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TRAPPC3O43617 180 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GATCO43716 136 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CACNG3O60359 315 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CYTIPO60759 359 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MFAP3LO75121 409 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GJB3O75712 270 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 BEST1O76090 585 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 IPO13O94829 963 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FKBP9O95302 570 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LCA5LO95447 670 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 OTCP00480 354 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NR2F1P10589 423 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KRT3P12035 628 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC130P13994 396 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CHN1P15882 459 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 BPIP17213 487 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GJA1P17302 382 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TYMPP19971 482 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PEX2P28328 305 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PCGF2P35227 344 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RABIFP47224 123 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PPP5CP53041 499 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RAD23AP54725 363 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MFAP3P55082 362 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RPP30P78346 268 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CREB5Q02930 508 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 KLC1Q07866 573 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SMARCB1Q12824 385 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CALCOCO2Q13137 446 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PPIL2Q13356 520 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 EPHA7Q15375 998 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ALX1Q15699 326 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TSTQ16762 297 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 INAVAQ3KP66 663 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FLYWCH1Q4VC44 716 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SLC44A4Q53GD3 710 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FAM76BQ5HYJ3 339 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 EFHC1Q5JVL4 640 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FAM209BQ5JX69 171 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO47Q5MNV8 452 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CLVS2Q5SYC1 327 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FOXB2Q5VYV0 432 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 GGT6Q6P531 493 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TTC23LQ6PF05 361 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DARS2Q6PI48 645 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 DEGS2Q6QHC5 323 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PET117Q6UWS5 81 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TRIM72Q6ZMU5 477 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PTF1AQ7RTS3 328 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RD3Q7Z3Z2 195 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RABEPKQ7Z6M1 372 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ASPGQ86U10 573 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TPRA1Q86W33 373 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC25Q86WR0 208 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC6Q86X45 466 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 RHPN2Q8IUC4 686 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PYROXD2Q8N2H3 581 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FBXW8Q8N3Y1 598 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CCNYL1Q8N7R7 359 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF680Q8NEM1 530 aa3.12□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 POC1BQ8TC44 478 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CREB3L4Q8TEY5 395 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF384Q8TF68 577 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 LMBR1Q8WVP7 490 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 STAMQ92783 540 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FBXW5Q969U6 566 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CALML4Q96GE6 196 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HES6Q96HZ4 224 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 FEM1CQ96JP0 617 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 C16orf92Q96LL3 132 aa3.12□□□□□ -1.91
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PTPRM-204ENST00000577468 CDRT15Q96T59 188 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PKP4Q99569 1192 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 TSC22D3Q99576 134 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PIP5K1AQ99755 562 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ACO2Q99798 780 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 ERP44Q9BS26 406 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 CNPPD1Q9BV87 410 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 NDEL1Q9GZM8 345 aa3.12□□□□□ -1.91
PTPRM-204ENST00000577468 HSD3B7Q9H2F3 369 aa3.12□□□□□ -1.91
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