RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000573600.5

CTDNEP1-208, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,724 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-208ENST00000573600 UGP2Q16851 508 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 RALGPS1Q5JS13 557 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 RETSATQ6NUM9 610 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 NDUFAF2Q8N183 169 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 BHMTQ93088 406 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 TRIB3Q96RU7 358 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 VPS11Q9H270 941 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC17A7Q9P2U7 560 aa29.39■■■□□ 2.3
CTDNEP1-208ENST00000573600 EBAG9O00559 213 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 SIN3BO75182 1162 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 GKAP1Q5VSY0 366 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 PEX13Q92968 403 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 ISL2Q96A47 359 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM167BQ9BTA0 163 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 LMAN2LQ9H0V9 348 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 PCMTD2Q9NV79 361 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 MROH6A6NGR9 719 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 ALDOAP04075 364 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 DHRS4L1P0CG22 281 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 TCF3P15923 654 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 TAC1P20366 129 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 HADHAP40939 763 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 ETV4P43268 484 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC12A1Q13621 1099 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 QPCTQ16769 361 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 LINGO4Q6UY18 593 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 ATP2A3Q93084 1043 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 MCMBPQ9BTE3 642 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLLPQ9Y342 182 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 TPP1O14773 563 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXN2P32314 431 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF697Q5TEC3 545 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 RBM23Q86U06 439 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 CALML6Q8TD86 181 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 LRRC8CQ8TDW0 803 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 EXOC2Q96KP1 924 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 FAM111AQ96PZ2 611 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC13A1Q9BZW2 595 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 TBC1D14Q9P2M4 693 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 GRID1Q9ULK0 1009 aa29.37■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 ARNTP27540 789 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 SERPINB8P50452 374 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLK1P53350 603 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 NTHL1P78549 312 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 LMAN2Q12907 356 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 FOXR1Q6PIV2 292 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 BRSK1Q8TDC3 778 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 PTPRN2Q92932 1015 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 CABS1Q96KC9 395 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLK2Q9NYY3 685 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 LHX3Q9UBR4 397 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 RIMKLBQ9ULI2 386 aa29.36■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 GOLGA8TH3BQL2 631 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 TYK2P29597 1187 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 RHOAP61586 193 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 FSTL4Q6MZW2 842 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 APCDD1Q8J025 514 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 DCLK2Q8N568 766 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF557Q8N988 423 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 RHOJQ9H4E5 214 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 TLE6Q9H808 572 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIDD1Q9HB75 910 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 DCDC2Q9UHG0 476 aa29.35■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 MAGEA12P43365 314 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 USP4Q13107 963 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 GALNT3Q14435 633 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 ZNF77Q15935 545 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 CDHR3Q6ZTQ4 885 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 PIGWQ7Z7B1 504 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP29.34■■■□□ 2.299e-8■■□□□ 13.7
CTDNEP1-208ENST00000573600 GGA2Q9UJY4 613 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 GLRA3O75311 464 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC20A2Q08357 652 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 PLEKHG6Q3KR16 790 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 NCEH1Q6PIU2 408 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 KIAA0408Q6ZU52 694 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 SPOCK2Q92563 424 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 OTUB2Q96DC9 234 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 VPS39Q96JC1 886 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 SEC16BQ96JE7 1060 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 CHKBQ9Y259 395 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 RAI2Q9Y5P3 530 aa29.34■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 SLC7A4O43246 635 aa29.33■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 LDB2O43679 373 aa29.33■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 MPOP05164 745 aa29.33■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 POLD2P49005 469 aa29.33■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 INSCQ1MX18 579 aa29.33■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 NEPROQ6NW34 567 aa29.33■■■□□ 2.29
CTDNEP1-208ENST00000573600 LMNTD2Q8IXW0 634 aa29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms