RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000562011.1

CTU2-203, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 2

Gene CTU2, Length 324 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-203ENST00000562011 PTP4A2Q12974 167 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 NR0B2Q15466 257 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 KLHL40Q2TBA0 621 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 BROXQ5VW32 411 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 GDPD4Q6W3E5 623 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TTC7BQ86TV6 843 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 MSANTD4Q8NCY6 345 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 DENND6BQ8NEG7 585 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 RAB7BQ96AH8 199 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TBC1D31Q96DN5 1066 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 SLC46A1Q96NT5 459 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 MAGEH1Q9H213 219 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 SPASTQ9UBP0 616 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 RABGEF1Q9UJ41 708 aa14.49□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TPP1O14773 563 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 YY2O15391 372 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 BUB1O43683 1085 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 RAMP2O60895 175 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 SDC4P31431 198 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ETFBP38117 255 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PTPN9P43378 593 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CDR2Q01850 454 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ARL13BQ3SXY8 428 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TCP11X2Q5H9J9 407 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 FAXCQ5TGI0 409 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 KCTD16Q68DU8 428 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ZNF354CQ86Y25 554 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 FAM172AQ8WUF8 416 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 EXOC2Q96KP1 924 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 EPAS1Q99814 870 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CCDC3Q9BQI4 270 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TTYH3Q9C0H2 523 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 VPS16Q9H269 839 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 THSD1Q9NS62 852 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 EVA1BQ9NVM1 165 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TMEM51Q9NW97 253 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 SSUH2Q9Y2M2 353 aa14.48□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CDRT15L2A8MXV6 281 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 LMO7DNF2Z398 122 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TM7SF2O76062 418 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PIGNO95427 931 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ANXA6P08133 673 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 SKOR1P84550 965 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 VAC14Q08AM6 782 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 IRF4Q15306 451 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 WDR59Q6PJI9 974 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 IGF2-ASQ6U949 168 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 STRADAQ7RTN6 431 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ZSCAN30Q86W11 494 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CXorf40AQ8TE69 158 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 BTN2A2Q8WVV5 523 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TTC9Q92623 222 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 HMCESQ96FZ2 354 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 DPH1Q9BZG8 443 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 SIRPGQ9P1W8 387 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 GULP1Q9UBP9 304 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 LHX3Q9UBR4 397 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PADI4Q9UM07 663 aa14.47□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 TNFSF15O95150 251 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 UNGP13051 313 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 UCNP55089 124 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 JAM2P57087 298 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 RHOAP61586 193 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 RHDQ02161 417 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 PTK2BQ14289 1009 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 CYTH1Q15438 398 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 WSCD2Q2TBF2 565 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 MACC1Q6ZN28 852 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 ZNF677Q86XU0 584 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 KYQ8NBH2 561 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 SLC13A1Q9BZW2 595 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa14.46□□□□□ -0.09
CTU2-203ENST00000562011 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
CTU2-203ENST00000562011 RASA4BC9J798 803 aa14.45□□□□□ -0.1
CTU2-203ENST00000562011 AGRPO00253 132 aa14.45□□□□□ -0.1
CTU2-203ENST00000562011 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms