RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 IGF2RP11717 2491 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 TSPAN11A1L157 253 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 FLRT2O43155 660 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 MAFKO60675 156 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 MTA2O94776 668 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 AKT2P31751 481 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 SHC2P98077 582 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 RAD51Q06609 339 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 HADHQ16836 314 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 SLC45A4Q5BKX6 768 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 SRLQ86TD4 932 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 GATAD2AQ86YP4 633 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 CAMK1DQ8IU85 385 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 OR13H1Q8NG92 308 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 PCDH19Q8TAB3 1148 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 SKA1Q96BD8 255 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 FEM1CQ96JP0 617 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 KLF6Q99612 283 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 SLC17A9Q9BYT1 436 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 TRPM6Q9BX84 2022 aa21.11■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 TSPAN6O43657 245 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 MFSD11O43934 449 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 SPINK2P20155 84 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 CSNK1DP48730 415 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 OVGP1Q12889 678 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 FOXC1Q12948 553 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 MESDQ14696 234 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 TMCO4Q5TGY1 634 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 TTC7BQ86TV6 843 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 PGBD5Q8N414 524 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 SAP25Q8TEE9 199 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 RFFLQ8WZ73 363 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 RAPGEF5Q92565 580 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 BMFQ96LC9 184 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 PSKH2Q96QS6 385 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 SUV39H2Q9H5I1 410 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa21.1■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 POM121BA6NF01 834 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 DFNA5O60443 496 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 THEGLP0DJG4 465 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 EPHA8P29322 1005 aaPredicted RBP21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 RXRGP48443 463 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 LBRQ14739 615 aaKnown RBP21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 PQLC3Q8N755 202 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 RHBDD1Q8TEB9 315 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 FAF2Q96CS3 445 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 KLHDC7BQ96G42 594 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 ZNF599Q96NL3 588 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 ZNF670Q9BS34 389 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 CALN1Q9BXU9 219 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 GPR27Q9NS67 375 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 TOR4AQ9NXH8 423 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 SEPT3Q9UH03 358 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa21.09■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 NEMP1O14524 444 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 PRKCGP05129 697 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 BNIP3Q12983 259 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 GLRX5Q86SX6 157 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 SLCO6A1Q86UG4 719 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 ATPAF2Q8N5M1 289 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 KCTD6Q8NC69 237 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 ECHDC3Q96DC8 303 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 PCDH12Q9NPG4 1184 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa21.08■□□□□ 0.97
CS-222ENST00000550996 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP21.08■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 MMP20O60882 483 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 MAP3K6O95382 1288 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 KRT7P08729 469 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 FTH1P19P0C7X4 201 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 CR2P20023 1033 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 SERPINB6P35237 376 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 GRK6P43250 576 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 SEMG2Q02383 582 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 PAFAH1B3Q15102 231 aaKnown RBP21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 PDK2Q15119 407 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 TCEAL1Q15170 157 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 UGP2Q16851 508 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 TPRG1LQ5T0D9 272 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 RHOT2Q8IXI1 618 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 PNPLA1Q8N8W4 532 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 HCAR2Q8TDS4 363 aa21.07■□□□□ 0.96
CS-222ENST00000550996 ASB12Q8WXK4 309 aa21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms