RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543088.5

TM7SF3-212, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 601 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-212ENST00000543088 INSIG1O15503 277 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 PIGNO95427 931 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 KRT7P08729 469 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 SERPINA4P29622 427 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 MAN1A1P33908 653 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 PRAMEF14Q5SWL7 426 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 BRAT1Q6PJG6 821 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 MAP7D3Q8IWC1 876 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 BBS5Q8N3I7 341 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 DENND6BQ8NEG7 585 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 CXorf40AQ8TE69 158 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 NSMCE1Q8WV22 266 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 ASB12Q8WXK4 309 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 TSC1Q92574 1164 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 VOPP1Q96AW1 172 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 CHP1Q99653 195 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 CALN1Q9BXU9 219 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 SUV39H2Q9H5I1 410 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 ITM2BQ9Y287 266 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 BTBD3Q9Y2F9 522 aa25.27■■□□□ 1.64
TM7SF3-212ENST00000543088 IGLON5A6NGN9 336 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 AREL1O15033 823 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF235Q14590 738 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 LBRQ14739 615 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 PDK2Q15119 407 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 KYAT3Q6YP21 454 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 GCNT7Q6ZNI0 430 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 SRLQ86TD4 932 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 GATAD2AQ86YP4 633 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 RHOT2Q8IXI1 618 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 PAF1Q8N7H5 531 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 SAP25Q8TEE9 199 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 SPTLC3Q9NUV7 552 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 ETNK2Q9NVF9 386 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 FTSJ1Q9UET6 329 aa25.26■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 TSPAN11A1L157 253 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 FPGTO14772 594 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 SHBQ15464 509 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 ERAP2Q6P179 960 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRC49Q8IUZ0 686 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 KCTD6Q8NC69 237 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 OR13H1Q8NG92 308 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 FAM71BQ8TC56 605 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 PSKH2Q96QS6 385 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 ZNF670Q9BS34 389 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 GGT7Q9UJ14 662 aa25.25■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 SPINT1O43278 529 aa25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 TNFSF14O43557 240 aa25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 TIMP2P16035 220 aa25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 RABIFP47224 123 aa25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 CLDN2P57739 230 aa25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 AP1S1P61966 158 aa25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 BCL2L1Q07817 233 aa25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 FGL2Q14314 439 aa25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 LRRC73Q5JTD7 316 aa25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 SCNM1Q9BWG6 230 aa25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 KLHL11Q9NVR0 708 aa25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 WASF3Q9UPY6 502 aa25.24■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 TM7SF2O76062 418 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 ARHGAP25P42331 645 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 DPYSL3Q14195 570 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 MESDQ14696 234 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 UGP2Q16851 508 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 Q6ZSR6 202 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 TP53INP2Q8IXH6 220 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC35G2Q8TBE7 412 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 RFFLQ8WZ73 363 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 IFT43Q96FT9 208 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 INTUQ9ULD6 942 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa25.23■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 RGRP47804 291 aa25.22■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 SCNN1BP51168 640 aa25.22■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 SLC10A7Q0GE19 358 aa25.22■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 MMRN1Q13201 1228 aa25.22■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 CAMK1DQ8IU85 385 aa25.22■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 RAD51BO15315 384 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 MAFKO60675 156 aa25.21■■□□□ 1.63
TM7SF3-212ENST00000543088 MTA2O94776 668 aa25.21■■□□□ 1.63
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