RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542921.5

JMJD1C-210, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene JMJD1C, Length 8,149 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-210ENST00000542921 PAGE1O75459 146 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 RPP40O75818 363 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 LATS1O95835 1130 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 OR4E1P0C645 316 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TRAPPC2P0DI81 140 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TRAPPC2BP0DI82 140 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 SPP1P10451 314 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 NR4A2P43354 598 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ART1P52961 327 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 MLLT10P55197 1068 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TRAF2Q12933 501 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 KCNA10Q16322 511 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 LONRF1Q17RB8 773 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TIGD6Q17RP2 521 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 LCN1P1Q5VSP4 162 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 GAREM2Q75VX8 874 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ARSGQ96EG1 525 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 PRMT1Q99873 361 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 B3GNT4Q9C0J1 378 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ETNK1Q9HBU6 452 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TUBG2Q9NRH3 451 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 GFOD1Q9NXC2 390 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 PRELID3BQ9Y3B1 194 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 SCRIBQ14160 1630 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 MAP3K5Q99683 1374 aa3.18□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D3DA0A087WVF3 549 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D3EA0A087X179 549 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 MEIS3P1A6NDR6 274 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D3BA6NDS4 549 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 LGALS16A8MUM7 142 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 A8MX80 341 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D3LB9A6J9 549 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 CHST10O43529 356 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 RNF13O43567 381 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 INMTO95050 263 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 SNAPINO95295 136 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ZBTB7AO95365 584 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 POU2F2P09086 479 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 FAM58BPP0C7Q3 252 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D3HP0C7X1 549 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 RAG1P15918 1043 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 PTPRAP18433 802 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 NT5EP21589 574 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 BDNFP23560 247 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 CMA1P23946 247 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 AOAHP28039 575 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 PRDX6P30041 224 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 SDC2P34741 201 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 FABP6P51161 128 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ITGA8P53708 1063 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 NR1H2P55055 460 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 OGDHQ02218 1023 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 MAPK7Q13164 816 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 CDK10Q15131 360 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 Q1RN00 199 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TYW3Q6IPR3 259 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 PXKQ7Z7A4 578 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TMED4Q7Z7H5 227 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 CCDC28AQ8IWP9 274 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 BANPQ8N9N5 519 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 GATSQ8NAP1 163 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 C3orf20Q8ND61 904 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 FNIP1Q8TF40 1166 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ASB8Q9H765 288 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 PTPRHQ9HD43 1115 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 DPP3Q9NY33 737 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ACSL6Q9UKU0 697 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 SNX8Q9Y5X2 465 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ABCB11O95342 1321 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ISPDA4D126 451 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF705FA8MVS1 300 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 EFCAB9A8MZ26 197 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ADAM10O14672 748 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 PDE8AO60658 829 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 CST8O60676 142 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 SBK2P0C263 348 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF705DP0CH99 300 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 ZNF705BP0CI00 300 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 NR2F6P10588 404 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 UROSP10746 265 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 NR2C1P13056 603 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 MAOBP27338 520 aa3.17□□□□□ -1.9
JMJD1C-210ENST00000542921 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP3.17□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms