RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540445.5

LMO3-222, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LMO3, Length 906 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-222ENST00000540445 GGT7Q9UJ14 662 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ITM2BQ9Y287 266 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.13□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 CACNA1GO43497 2377 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 LRP4O75096 1905 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 TRABD2BA6NFA1 517 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 RAD51BO15315 384 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 INSIG1O15503 277 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 SIGLEC6O43699 453 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 RFPL3O75679 317 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 TM7SF2O76062 418 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 SERPING1P05155 500 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 TIMP2P16035 220 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ERCC2P18074 760 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ITIH2P19823 946 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 PTMSP20962 102 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ABL2P42684 1182 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 SSR1P43307 286 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 RABIFP47224 123 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 THOP1P52888 689 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 GRM3Q14832 879 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ACAP1Q15027 740 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 FIGNQ5HY92 759 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 GCNT7Q6ZNI0 430 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 RFX8Q6ZV50 586 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ABI3BPQ7Z7G0 1075 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 TMPRSS12Q86WS5 348 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 MDM1Q8TC05 714 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 FNIP1Q8TF40 1166 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 TSC1Q92574 1164 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 HSPH1Q92598 858 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 VOPP1Q96AW1 172 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 PEBP4Q96S96 227 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 C1QTNF2Q9BXJ5 285 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ISCUQ9H1K1 167 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 LRRC19Q9H756 370 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ZWILCHQ9H900 591 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 SP110Q9HB58 689 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 UCKL1Q9NWZ5 548 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 IFNKQ9P0W0 207 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 MFHAS1Q9Y4C4 1052 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ASXL3Q9C0F0 2248 aa9.12□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 A0A1W2PQJ5 194 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 H3BM21 787 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 TRIM38O00635 465 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 PRAMEF11O60813 436 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 LRCH4O75427 683 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 PIAS2O75928 621 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 PIGNO95427 931 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ALPPL2P10696 532 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ARL4AP40617 200 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 HCAR3P49019 387 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ACADVLP49748 655 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ZBED6P86452 979 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 CYP4F3Q08477 520 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ELP6Q0PNE2 266 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 PTK2BQ14289 1009 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 UGP2Q16851 508 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 SMTNL2Q2TAL5 461 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 BOLA3Q53S33 107 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 CCDC122Q5T0U0 273 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 SRLQ86TD4 932 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 CAMK1DQ8IU85 385 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 LZTR1Q8N653 840 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 CENPTQ96BT3 561 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 IFT43Q96FT9 208 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 THAP2Q9H0W7 228 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 DKK3Q9UBP4 350 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 LHX3Q9UBR4 397 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 CAPN11Q9UMQ6 739 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 GPSM3Q9Y4H4 160 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 AK5Q9Y6K8 562 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 BPTFQ12830 3046 aa9.11□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 RP1P56715 2156 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 A0A087X0T9 212 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 H3BRJ5 948 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 MYO1FO00160 1098 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 AREL1O15033 823 aa9.1□□□□□ -0.95
LMO3-222ENST00000540445 SCAMP1O15126 338 aa9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.2 ms