RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 HORMAD1Q86X24 394 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 KATNAL2Q8IYT4 538 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 PLD5Q8N7P1 536 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 VOPP1Q96AW1 172 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 EBF2Q9HAK2 575 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 FSCN3Q9NQT6 498 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 FADS3Q9Y5Q0 445 aa22.21■■□□□ 1.15
PTPRK-222ENST00000532751 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 C4orf47A7E2U8 309 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 NEMP1O14524 444 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 TSPAN6O43657 245 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 NEBLO76041 1014 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 SUOXP51687 545 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 BCL2L1Q07817 233 aa22.2■■□□□ 1.14
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PTPRK-222ENST00000532751 NAPEPLDQ6IQ20 393 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 IL27RAQ6UWB1 636 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC50Q8IVM0 306 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 RCOR2Q8IZ40 523 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 PAF1Q8N7H5 531 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CCNYQ8ND76 341 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 HDAC11Q96DB2 347 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 SERAC1Q96JX3 654 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 SLC6A18Q96N87 628 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 TSGA13Q96PP4 275 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 DLL3Q9NYJ7 618 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 DTLQ9NZJ0 730 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 HEY1Q9Y5J3 304 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CFAP54Q96N23 3096 aa22.2■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CEP250Q9BV73 2442 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 MACROD2A1Z1Q3 448 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 MUSKO15146 869 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 MATN3O15232 486 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 ABL2P42684 1182 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CDKN2BP42772 138 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 C21orf59P57076 290 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 RPS21P63220 83 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 RALGPS1Q5JS13 557 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 BRAT1Q6PJG6 821 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC13Q8IYE1 715 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 SYCE1Q8N0S2 351 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 EXD1Q8NHP7 514 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 FATE1Q969F0 183 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 NUDCD1Q96RS6 583 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 MGME1Q9BQP7 344 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 SCUBE2Q9NQ36 999 aa22.19■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa22.19■■□□□ 1.14
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PTPRK-222ENST00000532751 TSPAN11A1L157 253 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 PRAMEF26H0Y7S4 382 aa22.18■■□□□ 1.14
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PTPRK-222ENST00000532751 DYNLT1P63172 113 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 ELP6Q0PNE2 266 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 SLC10A2Q12908 348 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 PDK1Q15118 436 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 TFDP3Q5H9I0 405 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CAMK1DQ8IU85 385 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 LRRC8AQ8IWT6 810 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 MINDY1Q8N5J2 469 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 TEX26Q8N6G2 289 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 MAML1Q92585 1016 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 NT5MQ9NPB1 228 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 AMACRQ9UHK6 382 aa22.18■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 TMEM131Q92545 1883 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CCDC66A2RUB6 948 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 VILLO15195 856 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CER1O95813 267 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 TIMP2P16035 220 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CR2P20023 1033 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 ITKQ08881 620 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 STAT4Q14765 748 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 TAZQ16635 292 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF284Q2VY69 593 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 UAP1L1Q3KQV9 507 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 KAZNQ674X7 775 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 PGBD5Q8N414 524 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 CXorf40AQ8TE69 158 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 KRT35Q92764 455 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 KLK6Q92876 244 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 AMFRQ9UKV5 643 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 ADGRG1Q9Y653 693 aa22.17■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 A0A1W2PQ67 120 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 GRID2IPA4D2P6 1211 aa22.16■■□□□ 1.14
PTPRK-222ENST00000532751 UPK3BL1B0FP48 263 aa22.16■■□□□ 1.14
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