RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525059.1

PTDSS2-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS2, Length 1,258 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS2-202ENST00000525059 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 MYOCQ99972 504 aa20.63■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 FRYQ5TBA9 3013 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 POM121BA6NF01 834 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 H3BRJ5 948 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 NEMP1O14524 444 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 ENC1O14682 589 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 RAD51BO15315 384 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 INSIG1O15503 277 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 CAPNS1P04632 268 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TCF4P15884 667 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 IL10RBQ08334 325 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 CCDC122Q5T0U0 273 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 Q6ZSR6 202 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 SLC25A45Q8N413 288 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 EID2Q8N6I1 236 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 NETO2Q8NC67 525 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 CENPTQ96BT3 561 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 CNDP2Q96KP4 475 aaKnown RBP20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 RBSNQ9H1K0 784 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 SUV39H2Q9H5I1 410 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 GGT7Q9UJ14 662 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 ITM2BQ9Y287 266 aa20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP20.62■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 RARAP10276 462 aa20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 DGKAP23743 735 aa20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 ARL4AP40617 200 aa20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 RABIFP47224 123 aa20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 GALNT15Q8N3T1 639 aa20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 OR8K1Q8NGG5 319 aa20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 FAM71BQ8TC56 605 aa20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 ZNF599Q96NL3 588 aa20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 DNAJC7Q99615 494 aa20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 NUP85Q9BW27 656 aa20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 ANAPC7Q9UJX3 599 aa20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 SPEGQ15772 3267 aa20.61■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 MYO1FO00160 1098 aa20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 FPGTO14772 594 aa20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 PALMO75781 387 aa20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 PFN3P60673 137 aa20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 UGP2Q16851 508 aa20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TMEM52BQ4KMG9 183 aa20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 BRAT1Q6PJG6 821 aa20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 EXOC2Q96KP1 924 aa20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 CSPG4P5Q96PW8 444 aa20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 PSKH2Q96QS6 385 aa20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 CALN1Q9BXU9 219 aa20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TRIM5Q9C035 493 aa20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP20.6■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TOR1BO14657 336 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 PIAS2O75928 621 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TPM1P09493 284 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 RGRP47804 291 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 ELP6Q0PNE2 266 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 ILKQ13418 452 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 FZD2Q14332 565 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 SLC18A3Q16572 532 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 SMTNL2Q2TAL5 461 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TMCO4Q5TGY1 634 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 SRLQ86TD4 932 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 GAS2L3Q86XJ1 694 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 BTBD6Q96KE9 485 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 SP110Q9HB58 689 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 PCDH18Q9HCL0 1135 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 ZMIZ1Q9ULJ6 1067 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 AKAP13Q12802 2813 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 IGF2RP11717 2491 aa20.59■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 GOLGA8CPA6NN73 597 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 DFFAO00273 331 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 MMP20O60882 483 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 MFAP3LO75121 409 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TM7SF2O76062 418 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 PIGNO95427 931 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 CSF2P04141 144 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 GIMD1P0DJR0 217 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 CKMT2P17540 419 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 AMPD1P23109 780 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 ACADVLP49748 655 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 AGERQ15109 404 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 PROX2Q3B8N5 592 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 TMCO3Q6UWJ1 677 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa20.58■□□□□ 0.89
PTDSS2-202ENST00000525059 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms