RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520462.5

TSNARE1-206, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene TSNARE1, Length 589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-206ENST00000520462 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 VSIG1Q86XK7 387 aa15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 RFX6Q8HWS3 928 aa15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC112Q8NEF3 446 aa15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 TPCN2Q8NHX9 752 aa15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 FAF2Q96CS3 445 aa15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 TMEM121BQ9BXQ6 578 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 GRPEL1Q9HAV7 217 aa15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 HAUS2Q9NVX0 235 aa15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 REXO2Q9Y3B8 237 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa15.64■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 A0A1W2PPC4 97 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 RCCD1A6NED2 376 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 C16orf96A6NNT2 1141 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 NEMP1O14524 444 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 APOL1O14791 398 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 PJA2O43164 708 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 MAFKO60675 156 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 IGHV4-34P06331 123 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 ADRB3P13945 408 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 CD59P13987 128 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 NUDT1P36639 197 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 AFF3P51826 1226 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 MARC1Q5VT66 337 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 TIGD7Q6NT04 549 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 NEK5Q6P3R8 708 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 PARS2Q7L3T8 475 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SRLQ86TD4 932 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 RAB7BQ96AH8 199 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SKA1Q96BD8 255 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 CAMK1GQ96NX5 476 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 DESI2Q9BSY9 194 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 GOLPH3Q9H4A6 298 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 PCDH15Q96QU1 1955 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 RNF103O00237 685 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SH3BP5O60239 455 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 TRIM16O95361 564 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SERPINA4P29622 427 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 GARSP41250 739 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 CSNK1DP48730 415 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SCNN1BP51168 640 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 PPP2CBP62714 309 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 PPP2CAP67775 309 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 NSUN2Q08J23 767 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC10A7Q0GE19 358 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 GALNT2Q10471 571 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SETMARQ53H47 684 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC45A4Q5BKX6 768 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 TRIM69Q86WT6 500 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 CCDC50Q8IVM0 306 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 PQLC3Q8N755 202 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 CCNYQ8ND76 341 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 KIAA1524Q8TCG1 905 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 PSKH2Q96QS6 385 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 ZDHHC5Q9C0B5 715 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 LACRTQ9GZZ8 138 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 TM9SF3Q9HD45 589 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SALL4Q9UJQ4 1053 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 MSRB2Q9Y3D2 182 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 HEY1Q9Y5J3 304 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 DUSP10Q9Y6W6 482 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 KNL1Q8NG31 2342 aa15.62■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SPEGQ15772 3267 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 A0A1W2PQU0 124 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 MACROD2A1Z1Q3 448 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 INSIG1O15503 277 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 ARHGAP6O43182 974 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 MAP3K6O95382 1288 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 PIGNO95427 931 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 MMP13P45452 471 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 TAS2R38P59533 333 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 AP1S1P61966 158 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 DYNLT1P63172 113 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 RACK1P63244 317 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 GBE1Q04446 702 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 BCL2L1Q07817 233 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 GRIK2Q13002 908 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 SLC14A1Q13336 389 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 TFDP2Q14188 446 aa15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
TSNARE1-206ENST00000520462 MFSD7Q6UXD7 560 aa15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.2 ms