RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RFTN1Q14699 578 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 NIPA2Q8N8Q9 360 aa17.03■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP17.03■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SUV39H2Q9H5I1 410 aa17.03■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 DPYSQ14117 519 aa17.02■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa17.02■□□□□ 0.32
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITM2BQ9Y287 266 aa17.02■□□□□ 0.32
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TSPAN11A1L157 253 aa17.01■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 H3BRJ5 948 aa17.01■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 SDC3O75056 442 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIAS2O75928 621 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TM7SF2O76062 418 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSF2P04141 144 aa17.01■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 IL1R2P27930 398 aa17.01■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 ACADVLP49748 655 aa17.01■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 HNRNPKP61978 463 aaKnown RBP eCLIP17.01■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 EXOC2Q96KP1 924 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF599Q96NL3 588 aa17.01■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa17.01■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 RARAP10276 462 aa17■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 CASP14P31944 242 aa17■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMCO4Q5TGY1 634 aa17■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 PARGQ86W56 976 aa17■□□□□ 0.31
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HOXC-AS3-202ENST00000513165 NUP85Q9BW27 656 aa17■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SP110Q9HB58 689 aa17■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UCKL1Q9NWZ5 548 aa17■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DNAJC28Q9NX36 388 aa17■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DKK4Q9UBT3 224 aa17■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP17■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYO1FO00160 1098 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DFFAO00273 331 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCAMP1O15126 338 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PIGNO95427 931 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GIMD1P0DJR0 217 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALPPL2P10696 532 aa16.99■□□□□ 0.31
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NME1P15531 152 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
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