RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511139.1

FAM172A-209, Transcript of family with sequence similarity 172 member A, human

TSL 5

Gene FAM172A, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM172A-209	ENST00000511139	PAK1	Q13153	545 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SMAD1	Q15797	465 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	C1orf220	Q5T0J3	134 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	DCAF12L1	Q5VU92	463 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TMEM270	Q6UE05	265 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GBP6	Q6ZN66	633 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TRIM69	Q86WT6	500 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PROSER1	Q86XN7	944 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	WFDC3	Q8IUB2	231 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ZNF655	Q8N720	491 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	NAT16	Q8N8M0	369 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TMIE	Q8NEW7	156 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ANKRD20A12P	Q8NF67	263 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ZNF397	Q8NF99	534 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ATL2	Q8NHH9	583 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ZCCHC14	Q8WYQ9	949 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	OR8D1	Q8WZ84	308 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HPS3	Q969F9	1004 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	NXPE2	Q96DL1	559 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PGAP3	Q96FM1	320 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TCTN2	Q96GX1	697 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GTPBP2	Q9BX10	602 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	FOXP3	Q9BZS1	431 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PABPC3	Q9H361	631 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GAREM1	Q9H706	876 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	DYRK4	Q9NR20	520 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HAUS2	Q9NVX0	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	C2orf42	Q9NWW7	574 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	WHRN	Q9P202	907 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SLC25A13	Q9UJS0	675 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ANKRD6	Q9Y2G4	727 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ZBTB32	Q9Y2Y4	487 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HS3ST3A1	Q9Y663	406 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TNRC6B	Q9UPQ9	1833 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139		A0A087WV48	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139		A0A1W2PQ67	120 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ANKRD34B	A5PLL1	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TMEM110-MUSTN1	A8MSY1	372 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	MCF2L	O15068	1137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	LAT	O43561	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PPM1B	O75688	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	BEST1	O76090	585 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GJB6	O95452	261 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TBX18	O95935	607 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ESR1	P03372	595 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	KLKB1	P03952	638 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ERBB2	P04626	1255 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	IRF1	P10914	325 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SFTPC	P11686	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	BCKDHB	P21953	392 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CD38	P28907	300 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HLA-F	P30511	346 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	KRT9	P35527	623 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	IL12RB1	P42701	662 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CTSK	P43235	329 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GPD2	P43304	727 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	BLK	P51451	505 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	COPA	P53621	1224 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CDH4	P55283	916 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	DLG4	P78352	724 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	PTK2B	Q14289	1009 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	STAT4	Q14765	748 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ACAP1	Q15027	740 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CST6	Q15828	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	CLPP	Q16740	277 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	EXOC3L4	Q17RC7	722 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	HLA-B	Q31612	363 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	C5orf22	Q49AR2	442 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	MS4A13	Q5J8X5	152 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	TRIM72	Q6ZMU5	477 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SLC26A9	Q7LBE3	791 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM172A-209	ENST00000511139	SLC41A1	Q8IVJ1	513 aa		4.55	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.7 ms