RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509784.1

CALCOCO2-216, Transcript of calcium binding and coiled-coil domain 2, human

TSL 4

Gene CALCOCO2, Length 578 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PIAS3	Q9Y6X2	628 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IL16	Q14005	1332 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KDM3A	Q9Y4C1	1321 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANKRD36B	Q8N2N9	1353 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZFYVE9	O95405	1425 aa		3.35	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KIDINS220	Q9ULH0	1771 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARHGAP10	A1A4S6	786 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NPIPB15	A6NHN6	443 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RHOD	O00212	210 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LDLRAD4	O15165	306 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TGFB1I1	O43294	461 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TACC1	O75410	805 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TIPRL	O75663	272 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SERPINC1	P01008	464 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PRKCG	P05129	697 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CLEC3B	P05452	202 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SPARC	P09486	303 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BMP5	P22003	454 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FMO4	P31512	558 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ABCD1	P33897	745 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CPA2	P48052	419 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PROK1	P58294	105 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARF3	P61204	181 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARF1	P84077	181 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PMPCA	Q10713	525 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RPE65	Q16518	533 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ME3	Q16798	604 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CEP78	Q5JTW2	689 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SNX30	Q5VWJ9	437 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZNF66	Q6ZN08	573 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MTERF4	Q7Z6M4	381 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PXK	Q7Z7A4	578 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TADA2B	Q86TJ2	420 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM160B2	Q86V87	743 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	IGFN1	Q86VF2	1251 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ETNPPL	Q8TBG4	499 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HASPIN	Q8TF76	798 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAR1	Q8WVX9	515 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KLHL29	Q96CT2	875 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CFAP53	Q96M91	514 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TEFM	Q96QE5	360 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FRG2B	Q96QU4	278 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PIP5K1A	Q99755	562 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SH2D3A	Q9BRG2	576 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	R3HDML	Q9H3Y0	253 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	BRF2	Q9HAW0	419 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SNTG1	Q9NSN8	517 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DIAPH3	Q9NSV4	1193 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZBTB40	Q9NUA8	1239 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MPP6	Q9NZW5	540 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	TBC1D14	Q9P2M4	693 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CTNNAL1	Q9UBT7	734 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	HSPB7	Q9UBY9	170 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CDH22	Q9UJ99	828 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	LAMP3	Q9UQV4	416 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	PSAT1	Q9Y617	370 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CALCOCO2-216	ENST00000509784	FAM135B	Q49AJ0	1406 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ABCC3	O15438	1527 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784		A6NCN8	305 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SNAP23	O00161	211 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DYNC1I1	O14576	645 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC25A17	O43808	307 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DOK2	O60496	412 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NEURL1	O76050	574 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLPI	P03973	132 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	WNT1	P04628	370 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	UQCRH	P07919	91 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MPG	P29372	298 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	MAPK4	P31152	587 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ICAM3	P32942	547 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARL3	P36405	182 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARL1	P40616	181 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ARSF	P54793	590 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	DRG2	P55039	364 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	NAP1L1	P55209	391 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	EIF3B	P55884	814 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	GHRHR	Q02643	423 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	CYP4A11	Q02928	519 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CALCOCO2-216	ENST00000509784	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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