RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499624.3

GABPB1-AS1-202, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GABPB1-AS1, Length 16,182 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LCN1P1Q5VSP4 162 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C1orf174Q8IYL3 243 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ROPN1LQ96C74 230 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 POLR2J2Q9GZM3 115 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 POLR2J3Q9H1A7 115 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C11orf49Q9H6J7 331 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PLGRKTQ9HBL7 147 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LATS2Q9NRM7 1088 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.57□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PDHBP11177 359 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CBX5P45973 191 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SULT1E1P49888 294 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MGAT5Q09328 741 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CXXC5Q7LFL8 322 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SYNE4Q8N205 404 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 KIF12Q96FN5 646 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COG8Q96MW5 612 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 OSBPL8Q9BZF1 889 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDH7Q9ULB5 785 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PCDHGB6Q9Y5F9 930 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SCN9AQ15858 1988 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NPIPA5A0A0B4J1W7 369 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 STK25O00506 426 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ASS1P00966 412 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 VAV1P15498 845 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NDUFV1P49821 464 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CDK18Q07002 472 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SWSAP1Q6NVH7 229 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CHST9Q7L1S5 443 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIM59Q8IWR1 403 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CAMK1GQ96NX5 476 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MAU2Q9Y6X3 613 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TTLL13PA6NNM8 815 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NUDT14O95848 222 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GYG1P46976 350 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CLCN5P51795 746 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RPS6P62753 249 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TMPRSS15P98073 1019 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 COASYQ13057 564 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NT5DC1Q5TFE4 455 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TRIM68Q6AZZ1 485 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ADAM32Q8TC27 787 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANKRD49Q8WVL7 239 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CXorf40BQ96DE9 158 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SAR1AQ9NR31 198 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CRLS1Q9UJA2 301 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 NCOR1O75376 2440 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 AGPSO00116 658 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DNTTP04053 509 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C8GP07360 202 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DSTNP60981 165 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FUT2Q10981 343 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ATAT1Q5SQI0 421 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C9orf131Q5VYM1 1079 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PYHIN1Q6K0P9 492 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 UGT2A3Q6UWM9 527 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LY9Q9HBG7 655 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ABHD10Q9NUJ1 306 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GMEB2Q9UKD1 530 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 A0A1W2PQ72 361 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ACKR2O00590 384 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CPT2P23786 658 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 IGFALSP35858 605 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 C2orf80Q0P641 193 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SMU1Q2TAY7 513 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ANXA8L1Q5VT79 327 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TCEAL6Q6IPX3 200 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 USP51Q70EK9 711 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DYDC2Q96IM9 177 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DMTF1Q9Y222 760 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GINS2Q9Y248 185 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SASH3O75995 380 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 GNA12Q03113 381 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 ITIH4Q14624 930 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 DCST1Q5T197 706 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 RFKQ969G6 155 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 CARD8Q9Y2G2 431 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PGAM1P18669 254 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 TDGQ13569 410 aa4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 LBRQ14739 615 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
GABPB1-AS1-202ENST00000499624 PDGFRLQ15198 375 aa4.56□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.3 ms