RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	ATM	Q13315	3056 aa		11.09	□□□□□ -0.63
SKAP2-209	ENST00000497511	SYNJ2BP-COX16	A0A087WUM0	186 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1B0GVL5	298 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	TCAF2	A6NFQ2	919 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	MCF2L	O15068	1137 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ADAM11	O75078	769 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOBTB3	O94955	611 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	GIMD1	P0DJR0	217 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PFKFB1	P16118	471 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	NR0B2	Q15466	257 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CNGA2	Q16280	664 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CBWD6	Q4V339	395 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CBWD3	Q5JTY5	395 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CBWD5	Q5RIA9	395 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	GUSBP11	Q6P575	273 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	JAML	Q86YT9	394 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF548	Q8NEK5	533 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	LMX1A	Q8TE12	382 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	TFAP2B	Q92481	460 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM131C	Q96AQ9	280 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC39A13	Q96H72	371 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	RPRD1A	Q96P16	312 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	NOX5	Q96PH1	765 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	IL12RB2	Q99665	862 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ZFYVE1	Q9HBF4	777 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	COX16	Q9P0S2	106 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ENTPD2	Q9Y5L3	495 aa		11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	11.08	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	LY6G6E	A0A0G2JKS1	128 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	MUSK	O15146	869 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	DDX3Y	O15523	660 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CHRNA3	P32297	505 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	RECQL	P46063	649 aa	Predicted RBP	11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	TAS2R38	P59533	333 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	NFKB2	Q00653	900 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PCDH1	Q08174	1060 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SPIDR	Q14159	915 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF284	Q2VY69	593 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PIP5KL1	Q5T9C9	394 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SYPL2	Q5VXT5	272 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SEL1L3	Q68CR1	1132 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	GCNT7	Q6ZNI0	430 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PARG	Q86W56	976 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC22A18AS	Q8N1D0	253 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	AGGF1	Q8N302	714 aa	eCLIP	11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ATP11C	Q8NB49	1132 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PPP1R16A	Q96I34	528 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	TSG101	Q99816	390 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SLTM	Q9NWH9	1034 aa	Known RBP eCLIP	11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511		U3KQA8	63 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		11.07	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	KCNU1	A8MYU2	1149 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	AQP9	O43315	295 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	TCEA3	O75764	348 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	TRUB2	O95900	331 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	F13A1	P00488	732 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PRNP	P04156	253 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	FYN	P06241	537 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ZSCAN22	P10073	491 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC2A3	P11169	496 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SYK	P43405	635 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ACADSB	P45954	432 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PLK1	P53350	603 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	KRT83	P78385	493 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PDE1C	Q14123	709 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SPRED3	Q2MJR0	410 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ARL13B	Q3SXY8	428 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ATL3	Q6DD88	541 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF574	Q6ZN55	896 aa	Predicted RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ERN2	Q76MJ5	926 aa	Known RBP	11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	ABI3BP	Q7Z7G0	1075 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	LURAP1L	Q8IV03	231 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PPM1K	Q8N3J5	372 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SH2D3C	Q8N5H7	860 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	EXD3	Q8N9H8	876 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	WDR48	Q8TAF3	677 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	GRIN3A	Q8TCU5	1115 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	EXTL1	Q92935	676 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	NAT6	Q93015	286 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	NT5C1B	Q96P26	610 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	FEM1A	Q9BSK4	669 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		11.06	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A1W2PNU3	283 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PMS2P1	A4D2B8	440 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	EME2	A4GXA9	379 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CDRT15L2	A8MXV6	281 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	FPGT	O14772	594 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC16A3	O15427	465 aa	Known RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	PAK4	O96013	591 aa	Predicted RBP	11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CALCA	P01258	141 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	CSF2	P04141	144 aa		11.05	□□□□□ -0.64
SKAP2-209	ENST00000497511	NTRK1	P04629	796 aa		11.05	□□□□□ -0.64

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