RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494672.1

CCDC66-222, Transcript of coiled-coil domain containing 66, human

TSL 4

Gene CCDC66, Length 577 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCDC66-222	ENST00000494672	PLOD3	O60568	738 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	DDHD2	O94830	711 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TSPY3	P0CV98	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TSPY8	P0CW00	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ARRB2	P32121	409 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	KRT20	P35900	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	MLH1	P40692	756 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	NEK3	P51956	506 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TSPY1	Q01534	308 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	DR1	Q01658	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	REL	Q04864	619 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TBX2	Q13207	712 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	DPYS	Q14117	519 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	C15orf59	Q2T9L4	293 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	THOC7	Q6I9Y2	204 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	KDELC1	Q6UW63	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	C16orf89	Q6UX73	402 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	HOOK3	Q86VS8	718 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	DDIAS	Q8IXT1	998 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	C10orf67	Q8IYJ2	551 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TMEM57	Q8N5G2	664 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	AADAT	Q8N5Z0	425 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	OR52K2	Q8NGK3	314 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC35B4	Q969S0	331 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	GCC1	Q96CN9	775 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	FAR2	Q96K12	515 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CEP295NL	Q96MC4	621 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TBCB	Q99426	244 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	GPR108	Q9NPR9	543 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CA14	Q9ULX7	337 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PCDHB7	Q9Y5E2	793 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ROCK1	Q13464	1354 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PLEKHG2	Q9H7P9	1386 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	DROSHA	Q9NRR4	1374 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PNMA6E	A0A0J9YXQ4	647 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672		A0A1B0GUA9	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	RPS10-NUDT3	A0A1W2PQS6	291 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	RHOD	O00212	210 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	NDUFAB1	O14561	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SNX4	O95219	450 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	NFATC1	O95644	943 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	IFNA2	P01563	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ATP6V1B1	P15313	513 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TGM2	P21980	687 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	MCM3	P25205	808 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PSMA4	P25789	261 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CD86	P42081	329 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	RANBP1	P43487	201 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC37A1	P57057	533 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	EVC	P57679	992 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CYP4A11	Q02928	519 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	RUNX1T1	Q06455	604 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PRKG2	Q13237	762 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PICALM	Q13492	652 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	WDR93	Q6P2C0	686 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	DLK2	Q6UY11	383 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	NANOGNB	Q7Z5D8	188 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	GALNT5	Q7Z7M9	940 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	MFN1	Q8IWA4	741 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ADPRHL1	Q8NDY3	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TRPC4AP	Q8TEL6	797 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TNIP3	Q96KP6	325 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ZNF347	Q96SE7	839 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	KATNAL1	Q9BW62	490 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TRIM4	Q9C037	500 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SFXN1	Q9H9B4	322 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PARVG	Q9HBI0	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	NLRC4	Q9NPP4	1024 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	ARGLU1	Q9NWB6	273 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PPP1R14D	Q9NXH3	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	DGKB	Q9Y6T7	804 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	PTPRG	P23470	1445 aa		4.85	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	NCAPD3	P42695	1498 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	SYNDIG1L	A6NDD5	238 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CCDC66-222	ENST00000494672	TMEM221	A6NGB7	291 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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