RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492582.5

CHKB-212, Transcript of choline kinase beta, humanhuman

TSL 2

Gene CHKB, Length 2,069 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKB-212ENST00000492582 FKTNO75072 461 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 ATXN1LP0C7T5 689 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 PGM1P36871 562 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 PRMT2P55345 433 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 POU4F1Q01851 419 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 TMCO4Q5TGY1 634 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 SLC8B1Q6J4K2 584 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 ARHGAP24Q8N264 748 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 DRC3Q9H069 523 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 XPR1Q9UBH6 696 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 MTRRQ9UBK8 725 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 PLA2G4CQ9UP65 541 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 C15orf41Q9Y2V0 281 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 SCN5AQ14524 2016 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 MROH6A6NGR9 719 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 PQBP1O60828 265 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 TPBGLP0DKB5 382 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 GRIA4P48058 902 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 EPGNQ6UW88 154 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 PDFQ9HBH1 243 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 DNMT3LQ9UJW3 386 aa29.09■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 A0A087X1B8 175 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 ACSL4O60488 711 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 MAGEC1O60732 1142 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 EFEMP2O95967 443 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 SLC6A4P31645 630 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 OMDQ99983 421 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 SEMA3CQ99985 751 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 POLR1EQ9GZS1 481 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 UNC93B1Q9H1C4 597 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 MUSKO15146 869 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 CHRNGP07510 517 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 LEPRP48357 1165 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 ARHGEF6Q15052 776 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 ZNF789Q5FWF6 425 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 CFAP157Q5JU67 520 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 CFAP52Q8N1V2 620 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 MOCOSQ96EN8 888 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 CEP295NLQ96MC4 621 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 RAP2CQ9Y3L5 183 aa29.08■■■□□ 2.25
CHKB-212ENST00000492582 GJB3O75712 270 aa29.07■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 LMNAP02545 664 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 CXCL10P02778 98 aa29.07■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 RPL17P18621 184 aaKnown RBP29.07■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 GNAZP19086 355 aa29.07■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 RAP1GDS1P52306 607 aa29.07■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 SLC12A2P55011 1212 aa29.07■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 DNAL1Q4LDG9 190 aa29.07■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 C1orf21Q9H246 121 aa29.07■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 TANC1Q9C0D5 1861 aa29.07■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 SLC7A4O43246 635 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 DLX3O60479 287 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 MPSTP25325 297 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 CCL23P55773 120 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 ZNF235Q14590 738 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 SPATA6LQ8N4H0 392 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 MAPK15Q8TD08 544 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 OR1D2P34982 312 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 CLCN5P51795 746 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 USP41Q3LFD5 358 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 SLC9B1Q4ZJI4 515 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 GALNT7Q86SF2 657 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 MFSD1Q9H3U5 465 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 DCLRE1BQ9H816 532 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 ACSS2Q9NR19 701 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 MCM8Q9UJA3 840 aa29.06■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 GJB5O95377 273 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 TUFMP49411 452 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 NUMBP49757 651 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 NAGLUP54802 743 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 ACSBG2Q5FVE4 666 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 PDZD8Q8NEN9 1154 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 AGR3Q8TD06 166 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 WDR60Q8WVS4 1066 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 OVCA2Q8WZ82 227 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 ZNF599Q96NL3 588 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 NDNQ99608 321 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 OLFM1Q99784 485 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 VN1R3Q9BXE9 311 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 BACE2Q9Y5Z0 518 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 A0A0D9SEW6 157 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 LDB2O43679 373 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 HOXD9P28356 352 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 CCR10P46092 362 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 ARSDP51689 593 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 CCNG1P51959 295 aa29.05■■■□□ 2.24
CHKB-212ENST00000492582 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.5 ms