RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489741.1

PRPF40A-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 3

Gene PRPF40A, Length 776 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-210ENST00000489741 FAM217AQ8IXS0 508 aa6.66□□□□□ -1.34
PRPF40A-210ENST00000489741 CEP57L1Q8IYX8 460 aa6.66□□□□□ -1.34
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PRPF40A-210ENST00000489741 FBXW5Q969U6 566 aa6.66□□□□□ -1.34
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PRPF40A-210ENST00000489741 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
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PRPF40A-210ENST00000489741 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
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PRPF40A-210ENST00000489741 ZNF510Q9Y2H8 683 aa6.65□□□□□ -1.34
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PRPF40A-210ENST00000489741 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.65□□□□□ -1.34
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PRPF40A-210ENST00000489741 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.64□□□□□ -1.35
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PRPF40A-210ENST00000489741 H0Y626 953 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 K7ESM1 405 aa6.64□□□□□ -1.35
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PRPF40A-210ENST00000489741 CBFA2T3O75081 653 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM16O95361 564 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 CRTAMO95727 393 aa6.64□□□□□ -1.35
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PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM49P0CI25 452 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 TRIM49CP0CI26 452 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 PYGMP11217 842 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 CHKAP35790 457 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 PIK3CAP42336 1068 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 NDUFA8P51970 172 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 COPAP53621 1224 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 RAD23BP54727 409 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 MFAP3P55082 362 aa6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PRPF40A-210ENST00000489741 GOLGA8FQ08AF8 430 aa6.64□□□□□ -1.35
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