RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487539.1

CNN3-206, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 739 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-206ENST00000487539 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 IGFBP7Q16270 282 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 FAM160B1Q5W0V3 765 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 MFSD6Q6ZSS7 791 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 LPCAT2Q7L5N7 544 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 ERICH1Q86X53 443 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 IL17RDQ8NFM7 739 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 KAT5Q92993 513 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 MSANTD3Q96H12 275 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 CPB2Q96IY4 423 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 FAM227BQ96M60 508 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 EBF3Q9H4W6 596 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 LY9Q9HBG7 655 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 GALNT9Q9HCQ5 603 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 TCF7L1Q9HCS4 588 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 JKAMPQ9P055 326 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 MTRRQ9UBK8 725 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa4.73□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 E2F8A0AVK6 867 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 PIPSLA2A3N6 862 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 UNC119BA6NIH7 251 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 ZNF197O14709 1029 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 ADAMTS3O15072 1205 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 ERN1O75460 977 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 ABLIM3O94929 683 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 STBD1O95210 358 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 SPDEFO95238 335 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 VNN2O95498 520 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 ELANEP08246 267 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 PDGFRBP09619 1106 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 HKR1P10072 659 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 PDCP20941 246 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 TMOD1P28289 359 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 SMARCA1P28370 1054 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 TKTP29401 623 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 HSD11B2P80365 405 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 ROR1Q01973 937 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 TWF1Q12792 350 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 SLC14A1Q13336 389 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 LCE1AQ5T7P2 110 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 CYP4A22Q5TCH4 519 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 EMC10Q5UCC4 262 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 B3GNTL1Q67FW5 361 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 MIS18BP1Q6P0N0 1132 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 C1orf228Q6PIY5 440 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 USP49Q70CQ1 688 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 CYB5R4Q7L1T6 521 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 RHPN2Q8IUC4 686 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 C3orf20Q8ND61 904 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 RSPH1Q8WYR4 309 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 FGF11Q92914 225 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 ERLEC1Q96DZ1 483 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 RNF31Q96EP0 1072 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 COQ10AQ96MF6 247 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 NLRP4Q96MN2 994 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 ZSWIM1Q9BR11 485 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 ALOXE3Q9BYJ1 711 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 CD93Q9NPY3 652 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 PACSIN3Q9UKS6 424 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 INSL5Q9Y5Q6 135 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 NID2Q14112 1375 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 CENPEQ02224 2701 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 SALL3Q9BXA9 1300 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 CNTNAP2Q9UHC6 1331 aa4.72□□□□□ -1.65
CNN3-206ENST00000487539 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 A0A0D9SFI3 127 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 FAM86B1E9PN63 330 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 K7EQS6 105 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 PRRG1O14668 218 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 SLC43A1O75387 559 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 PRSS23O95084 383 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 AFPP02771 609 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 PRKCBP05771 671 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 FAM86B2P0C5J1 330 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 MALP21145 153 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 PROZP22891 400 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 KIF5BP33176 963 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 BRCC3P46736 316 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 NOMO3P69849 1222 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 GRIK2Q13002 908 aa4.71□□□□□ -1.66
CNN3-206ENST00000487539 TP53BP2Q13625 1128 aa4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms