RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487305.5

TMEM39B-208, Transcript of transmembrane protein 39B, human

TSL 2

Gene TMEM39B, Length 2,087 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMEM39B-208	ENST00000487305	IGLV3-25	P01717	112 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	USP17L7	P0C7H9	530 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	INHBE	P58166	350 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	NFKB2	Q00653	900 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	MS4A2	Q01362	244 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ITGA7	Q13683	1181 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	LRP8	Q14114	963 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	MFSD10	Q14728	455 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	RANBP10	Q6VN20	620 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	TP53INP2	Q8IXH6	220 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	DRAXIN	Q8NBI3	349 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	AGR3	Q8TD06	166 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	RNF34	Q969K3	372 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZUFSP	Q96AP4	578 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	NXNL1	Q96CM4	212 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	PCED1B	Q96HM7	432 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ELMO2	Q96JJ3	720 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	PKP2	Q99959	881 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	HOPX	Q9BPY8	73 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	POMK	Q9H5K3	350 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	TUBA8	Q9NY65	449 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	UBAP1	Q9NZ09	502 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ADA2	Q9NZK5	511 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	PTBP2	Q9UKA9	531 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	MAGED2	Q9UNF1	606 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	HAS3	O00219	553 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	VILL	O15195	856 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	PGK1	P00558	417 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	MYCN	P04198	464 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF26	P17031	533 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	TAS2R39	P59534	338 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	TMEM62	Q0P6H9	643 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	OLIG2	Q13516	323 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	EIF4EBP2	Q13542	120 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	FASTK	Q14296	549 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	PPP2R5D	Q14738	602 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	TECRL	Q5HYJ1	363 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	COQ5	Q5HYK3	327 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	TAF2	Q6P1X5	1199 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	TSPEAR	Q8WU66	669 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ACBD6	Q9BR61	282 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	MUC13	Q9H3R2	512 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ANLN	Q9NQW6	1124 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ARMC1	Q9NVT9	282 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	CACNA2D2	Q9NY47	1150 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305		Q9Y3F1	56 aa		12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF638	Q14966	1978 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	WASH4P	A8MWX3	477 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305		I6L893	689 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	PTGES	O14684	152 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC7A4	O43246	635 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF23	P17027	643 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	IMPDH1	P20839	514 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	SAT1	P21673	171 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	CCR1	P32246	355 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC1A2	P43004	574 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	GLRB	P48167	497 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	CPT1A	P50416	773 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	PKNOX1	P55347	436 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	STX1B	P61266	288 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	MYBPC1	Q00872	1141 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	SULT2A1	Q06520	285 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	TSTD2	Q5T7W7	516 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	TWF2	Q6IBS0	349 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	METTL23	Q86XA0	190 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	CHERP	Q8IWX8	916 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	LILRA2	Q8N149	483 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	TXNDC5	Q8NBS9	432 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ACVR1C	Q8NER5	493 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	FAM81A	Q8TBF8	368 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	HEXDC	Q8WVB3	486 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	TMA16	Q96EY4	203 aa	Known RBP	12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	CNBD2	Q96M20	576 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	APOL2	Q9BQE5	337 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	SLC25A51	Q9H1U9	297 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	RNF39	Q9H2S5	420 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ABCC13	Q9NSE7	274 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	CROT	Q9UKG9	612 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	AK5	Q9Y6K8	562 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	AQP12B	A6NM10	295 aa		12.49	□□□□□ -0.41
TMEM39B-208	ENST00000487305	ZNF701	M0R085	212 aa	Predicted RBP	12.49	□□□□□ -0.41

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