RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487169.5

HDLBP-241, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 2

Gene HDLBP, Length 4,339 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-241ENST00000487169 ACBD6Q9BR61 282 aa13.46□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 MFSD1Q9H3U5 465 aa13.46□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 RPS6KB2Q9UBS0 482 aa13.46□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 STK39Q9UEW8 545 aa13.46□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 PSME2Q9UL46 239 aa13.46□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ATRNL1Q5VV63 1379 aa13.46□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa13.45□□□□□ -0.26
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HDLBP-241ENST00000487169 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.267e-6■■■■□ 20.7
HDLBP-241ENST00000487169 C22orf31O95567 290 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 NUP107P57740 925 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 YBEYP58557 167 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 EML3Q32P44 896 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 MON1BQ7L1V2 547 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 OR4L1Q8NH43 312 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 SMG7Q92540 1137 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 BCAS3Q9H6U6 928 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 SAR1AQ9NR31 198 aa13.45□□□□□ -0.26
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HDLBP-241ENST00000487169 DEC1Q9P2X7 70 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.45□□□□□ -0.26
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HDLBP-241ENST00000487169 ARL5CA6NH57 179 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ADAMTS3O15072 1205 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 LRIG2O94898 1065 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 C2P06681 752 aa13.45□□□□□ -0.26
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HDLBP-241ENST00000487169 TAF5Q15542 800 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 PDK4Q16654 411 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 PRMT9Q6P2P2 845 aa13.45□□□□□ -0.26
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HDLBP-241ENST00000487169 PCDHGC3Q9UN70 934 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 RFWD3Q6PCD5 774 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 FUKQ8N0W3 1084 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 VMP1Q96GC9 406 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 MBOAT7Q96N66 472 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ZFP14Q9HCL3 533 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 PDP2Q9P2J9 529 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 SALL4Q9UJQ4 1053 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 COG5Q9UP83 839 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 NEDD8-MDP1E9PL57 170 aa13.45□□□□□ -0.26
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HDLBP-241ENST00000487169 INHAP05111 366 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 LRPAP1P30533 357 aa13.45□□□□□ -0.26
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HDLBP-241ENST00000487169 SLC30A9Q6PML9 568 aa13.45□□□□□ -0.26
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HDLBP-241ENST00000487169 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 TPD52L3Q96J77 140 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 HIC2Q96JB3 615 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP13.45□□□□□ -0.26
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HDLBP-241ENST00000487169 SLC12A4Q9UP95 1085 aa13.45□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 FAM220BPB1ANY3 271 aa13.44□□□□□ -0.26
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HDLBP-241ENST00000487169 COX7A2P14406 83 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CES1P23141 567 aa13.44□□□□□ -0.26
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HDLBP-241ENST00000487169 ZNF839A8K0R7 811 aa13.44□□□□□ -0.26
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HDLBP-241ENST00000487169 UGT2B4P06133 528 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 HNRNPLP14866 589 aaKnown RBP eCLIP13.44□□□□□ -0.264e-18■□□□□ 11
HDLBP-241ENST00000487169 AMD1P17707 334 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 GSSP48637 474 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CCL14Q16627 93 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 CCDC142Q17RM4 750 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 ALFQ53S48 1182 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa13.44□□□□□ -0.26
HDLBP-241ENST00000487169 TRABD2AQ86V40 505 aa13.44□□□□□ -0.26
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