RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486388.5

UBP1-210, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 3

Gene UBP1, Length 928 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-210	ENST00000486388	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	FZD4	Q9ULV1	537 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CLCA2	Q9UQC9	943 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TLR6	Q9Y2C9	796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PIEZO2	Q9H5I5	2752 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	COL5A1	P20908	1838 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM131	Q92545	1883 aa		4.88	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CKAP5	Q14008	2032 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KALRN	O60229	2985 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MYOCOS	A0A1B0GUC4	107 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TARSL2	A2RTX5	802 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	NEMP2	A6NFY4	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TLR4	O00206	839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MID1	O15344	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	BRINP1	O60477	761 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	IL1B	P01584	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	APOE	P02649	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PRB1	P04280	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SRPRA	P08240	638 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SETSIP	P0DME0	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	EPB41	P11171	864 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PLA2G2A	P14555	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CD19	P15391	556 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF18	P17022	549 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	GOT1	P17174	413 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TPP2	P29144	1249 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	EPHA8	P29322	1005 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SLC8A1	P32418	973 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ETV3	P41162	512 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	GCLM	P48507	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	GIPR	P48546	466 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PSMD8	P48556	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ACADVL	P49748	655 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MXI1	P50539	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CCR5	P51681	352 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	BNC1	Q01954	994 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TLE3	Q04726	772 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SULT2A1	Q06520	285 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ADIG	Q0VDE8	80 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	DNAJC3	Q13217	504 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CUL4B	Q13620	913 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ELAVL3	Q14576	367 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	STIL	Q15468	1287 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	HNRNPA1L2	Q32P51	320 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	RAB41	Q5JT25	222 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	BSPRY	Q5W0U4	402 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TMEM215	Q68D42	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ARHGAP17	Q68EM7	881 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KDM7A	Q6ZMT4	941 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ADIPOR2	Q86V24	386 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MMAA	Q8IVH4	418 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CARNMT1	Q8N4J0	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	DDX51	Q8N8A6	666 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	C19orf47	Q8N9M1	422 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	FBXL13	Q8NEE6	735 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	FIBIN	Q8TAL6	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TAS1R2	Q8TE23	839 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ZNF669	Q96BR6	464 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	WBP1	Q96G27	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CCDC114	Q96M63	670 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SLC6A18	Q96N87	628 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ULBP1	Q9BZM6	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	NEUROG2	Q9H2A3	272 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CNGB3	Q9NQW8	809 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	THSD1	Q9NS62	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CISH	Q9NSE2	258 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SFMBT1	Q9UHJ3	866 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	STOML2	Q9UJZ1	356 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KIAA1257	Q9ULG3	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	MTMR6	Q9Y217	621 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	DMTF1	Q9Y222	760 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	KCTD3	Q9Y597	815 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		4.87	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	APC2	O95996	2303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	FITM1	A5D6W6	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	C1QTNF3-AMACR	E9PGA6	284 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	PRAMEF26	H0Y7S4	382 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SMAD7	O15105	426 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	CETN3	O15182	167 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	SLC7A4	O43246	635 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	ACSL4	O60488	711 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	TRIM13	O60858	407 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	DNAJC6	O75061	913 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	FBXO21	O94952	628 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	F13A1	P00488	732 aa		4.86	□□□□□ -1.63
UBP1-210	ENST00000486388	IGHV4-34	P06331	123 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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