RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486161.5

PTPRD-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 5,039 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-211ENST00000486161 CD101Q93033 1021 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PEBP4Q96S96 227 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 HCSTQ9UBK5 93 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 GNPTGQ9UJJ9 305 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 GGA2Q9UJY4 613 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 STK38LQ9Y2H1 464 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CRYL1Q9Y2S2 319 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RPN2P04844 631 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TYRP14679 529 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CPA3P15088 417 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CYP2A7P20853 494 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 FMO4P31512 558 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 GALNT2Q10471 571 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CNGA3Q16281 694 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CCDC153Q494R4 210 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 LY6G5CQ5SRR4 150 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CERCAMQ5T4B2 595 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 DCAF12L1Q5VU92 463 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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PTPRD-211ENST00000486161 DCAF4L2Q8NA75 395 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SMARCD2Q92925 531 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SLCO2A1Q92959 643 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRD-211ENST00000486161 AVILO75366 819 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 GRK2P25098 689 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 AAK1Q2M2I8 961 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RASIP1Q5U651 963 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ZNF783Q6ZMS7 281 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SPATA21Q7Z572 469 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SPATA22Q8NHS9 363 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ARL8AQ96BM9 186 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 COPS8Q99627 209 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 BPIFA1Q9NP55 256 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 MARCH5Q9NX47 278 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 FOCADQ5VW36 1801 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 C2orf78A6NCI8 922 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 HAUS5O94927 633 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 NUDT17P0C025 328 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 DGKAP23743 735 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 HTR1BP28222 390 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 WASP42768 502 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 USP46P62068 366 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CRYMQ14894 314 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 FAM45BPQ6NSW5 357 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 KLHDC10Q6PID8 442 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RHBDF2Q6PJF5 856 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 GPR65Q8IYL9 337 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RGL4Q8IZJ4 473 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 FAM45AQ8TCE6 357 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 MCOLN3Q8TDD5 553 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 STYXQ8WUJ0 223 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 KLHL29Q96CT2 875 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 FEM1CQ96JP0 617 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RIC8BQ9NVN3 520 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 BAG5Q9UL15 447 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D3IA0A087WXS9 549 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D3EA0A087X179 549 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 A0A087X1B8 175 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D3KA0A087X1G2 549 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D3FA6NER0 549 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D3LB9A6J9 549 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP8.34□□□□□ -1.07
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PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D3HP0C7X1 549 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 EPCAMP16422 314 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 ITGB6P18564 788 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 HOXC8P31273 242 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 HALP42357 657 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PTGIRP43119 386 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 IL2P60568 153 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SEMA5AQ13591 1074 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 MAPRE2Q15555 327 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 CARD16Q5EG05 197 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RD3Q7Z3Z2 195 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SYT11Q9BT88 431 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRD-211ENST00000486161 RAD51BO15315 384 aa8.34□□□□□ -1.08
PTPRD-211ENST00000486161 RPP40O75818 363 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.08
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