RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483639.1

UBE2Q1-205, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2Q1, Length 694 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1-205ENST00000483639 LENG8Q96PV6 779 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 LGMNQ99538 433 aa11.54□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 DUSP23Q9BVJ7 150 aa11.54□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 ABCG4Q9H172 646 aa11.54□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 USP29Q9HBJ7 922 aa11.54□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 KCND1Q9NSA2 647 aa11.54□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 TMEM248Q9NWD8 314 aa11.54□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 CPED1A4D0V7 1026 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 H3BM21 787 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 AREL1O15033 823 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 CASC3O15234 703 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 AQP9O43315 295 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 RAMP2O60895 175 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 GSRP00390 522 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 ITIH2P19823 946 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 SOX5P35711 763 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 IGFALSP35858 605 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 PTPN9P43378 593 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 LSSP48449 732 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 CXADRP78310 365 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 PTP4A2Q12974 167 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 NR1I3Q14994 352 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 POLD3Q15054 466 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 MYLK3Q32MK0 819 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 CRTC1Q6UUV9 634 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 NYAP1Q6ZVC0 841 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 GPR155Q7Z3F1 870 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF677Q86XU0 584 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 PYROXD2Q8N2H3 581 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF248Q8NDW4 579 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM172AQ8WUF8 416 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 ASB12Q8WXK4 309 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 RAB7BQ96AH8 199 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 CENPTQ96BT3 561 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 TBC1D31Q96DN5 1066 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 KLHL32Q96NJ5 620 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 PCDHB18PQ96TA0 734 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 KLC2Q9H0B6 622 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 MAGEH1Q9H213 219 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 NLRC4Q9NPP4 1024 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa11.53□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.56
UBE2Q1-205ENST00000483639 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 PMS2P1A4D2B8 440 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 TK2O00142 265 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 ARHGAP6O43182 974 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 TEX33O43247 280 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 ZSCAN12O43309 604 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 BUB1O43683 1085 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 KDELR3O43731 214 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 MMP20O60882 483 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 GCATO75600 419 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 DXOO77932 396 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 TMCC1O94876 653 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 POP4O95707 220 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 UNGP13051 313 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 COPB1P53618 953 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 JAM2P57087 298 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 C19orf57Q0VDD7 668 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 C1orf61Q13536 156 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 KRT31Q15323 416 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 ISXQ2M1V0 245 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 PERM1Q5SV97 790 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 GDPD4Q6W3E5 623 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 STRADAQ7RTN6 431 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 VPS36Q86VN1 386 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 DENND6BQ8NEG7 585 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 LRRC61Q9BV99 259 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 VPS16Q9H269 839 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 RETREG1Q9H6L5 497 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 ASCL3Q9NQ33 180 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 MBNL1Q9NR56 388 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 HPCAL4Q9UM19 191 aa11.52□□□□□ -0.57
UBE2Q1-205ENST00000483639 SATB2Q9UPW6 733 aa11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms