RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IFRD1O00458 451 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNASEH1O60930 286 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CENPAP49450 140 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PFKPQ01813 784 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC10A6Q3KNW5 377 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCBLD1Q8N8Z6 715 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PANX3Q96QZ0 392 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LPIN3Q9BQK8 851 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYT17Q9BSW7 474 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DNMT3LQ9UJW3 386 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 VWA7Q9Y334 891 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP16.71■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 137.9
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPTORQ8N122 1335 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MPSTP25325 297 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FLT3LGP49771 235 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FKBP1BP68106 108 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 JAG1P78504 1218 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPIRE1Q08AE8 756 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LIPMQ5VYY2 423 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNSTQ6PJW8 725 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SYT12Q8IV01 421 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EID3Q8N140 333 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC185Q8N715 623 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANKRD27Q96NW4 1050 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DGCR6LQ9BY27 220 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNX10Q9Y5X0 201 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BTBD19C9JJ37 291 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SERPINA6P08185 405 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CFHP08603 1231 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MRPL57Q9BQC6 102 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLIC5Q9NZA1 410 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 EFR3BQ9Y2G0 817 aa16.71■□□□□ 0.27
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ALDH1A2O94788 518 aa16.71■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MMP3P08254 477 aa16.71■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANPEPP15144 967 aa16.71■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMEM26Q6ZUK4 368 aa16.71■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRIM69Q86WT6 500 aa16.71■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FNIP1Q8TF40 1166 aa16.71■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C12orf42Q96LP6 360 aa16.71■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FZD9O00144 591 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPAN1O60635 241 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LINC00032P0C843 101 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FECHP22830 423 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LMO2P25791 158 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR1D2P34982 312 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GPR15P49685 360 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRMT9Q6P2P2 845 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCTD15Q96SI1 283 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLOD4Q9HC38 313 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CYP4X1Q8N118 509 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TOP6BLQ8N6T0 577 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GMLQ99445 158 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RGS14O43566 566 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CABYRO75952 493 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HOXC6P09630 235 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPL9P32969 192 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TAF10Q12962 218 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TUSC3Q13454 348 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAPK11Q15759 364 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC44A4Q53GD3 710 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF516Q92618 1163 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NACC2Q96BF6 587 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC4A5Q9BY07 1137 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GLTPD2A6NH11 291 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ELNP15502 786 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MAD2L1Q13257 205 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM45BPQ6NSW5 357 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GCNT7Q6ZNI0 430 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FAM45AQ8TCE6 357 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPAS2Q99743 824 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RHOJQ9H4E5 214 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ARHGEF4Q9NR80 690 aa16.7■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TBL1XO60907 577 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FGD3Q5JSP0 725 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POTEHQ6S545 545 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DHDDSQ86SQ9 333 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANAPC2Q9UJX6 822 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H3BN98 237 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA31D3P0C874 917 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 UNGP13051 313 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TCF4P15884 667 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PIK3R1P27986 724 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa16.69■□□□□ 0.26
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MON1AQ86VX9 555 aa16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms