RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa21.19■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 GGT7Q9UJ14 662 aa21.19■□□□□ 0.98
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ACTB-211ENST00000480301 TSPAN11A1L157 253 aa21.18■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 BTNL10A8MVZ5 291 aa21.18■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 MAP3K6O95382 1288 aa21.18■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 CTSKP43235 329 aa21.18■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 VAV2P52735 878 aa21.18■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 ZNF235Q14590 738 aa21.18■□□□□ 0.98
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ACTB-211ENST00000480301 KIAA1161Q6NSJ0 714 aa21.18■□□□□ 0.98
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ACTB-211ENST00000480301 CA5BQ9Y2D0 317 aa21.17■□□□□ 0.98
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ACTB-211ENST00000480301 CD59P13987 128 aa21.16■□□□□ 0.98
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ACTB-211ENST00000480301 MMP13P45452 471 aa21.16■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 C21orf59P57076 290 aa21.16■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 AP1S1P61966 158 aa21.16■□□□□ 0.98
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ACTB-211ENST00000480301 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa21.16■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 IGLON5A6NGN9 336 aa21.15■□□□□ 0.98
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ACTB-211ENST00000480301 UPK3BL2E5RIL1 263 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 NEMP1O14524 444 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 MATN3O15232 486 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 MX2P20592 715 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 SERPINA4P29622 427 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 CDKN2BP42772 138 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 MARCKSL1P49006 195 aa21.15■□□□□ 0.98
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ACTB-211ENST00000480301 STAT4Q14765 748 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 ZNF423Q2M1K9 1284 aa21.15■□□□□ 0.98
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ACTB-211ENST00000480301 PIP4P1Q86T03 277 aa21.15■□□□□ 0.98
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ACTB-211ENST00000480301 ZSCAN30Q86W11 494 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 KATNAL2Q8IYT4 538 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 FATE1Q969F0 183 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 SKA1Q96BD8 255 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 ECHDC3Q96DC8 303 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 DESI2Q9BSY9 194 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 FZD3Q9NPG1 666 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 LAMA1P25391 3075 aa21.15■□□□□ 0.98
ACTB-211ENST00000480301 A0A0U1RQJ8 604 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 H0Y8X5 98 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 TLR4O00206 839 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 APOL1O14791 398 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 KCNK5O95279 499 aa21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
ACTB-211ENST00000480301 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
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